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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002793`

染色体: Chr05 坐标: 32647366-32651792 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002793`
名称	SmilChr05G002793
描述	uncharacterized SmilChr05G002793
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	32647366 - 32651792 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986879`
GeneID	`130986879`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986879`
原始查询	`SmilChr05G002793`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	NHL domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820715]; symbol=AT3G14860; hit=AT3G14860; species=arabidopsis; confidence=high
产物	NHL domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820715]; symbol=AT3G14860; hit=AT3G14860; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G14860` (AT3G14860) NHL domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820715] identity=58.5; qcov=0.99; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0234200` (FUWA) - identity=53.3; qcov=0.954; evalue=1.08e-159; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF01436 (NHL)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986879

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.60000	`XP_057766395.1`
2	Nucleus membrane	核膜	0.40000	`XP_057766396.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.40000	`XP_057766395.1`
4	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057766395.1`
5	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.20000	`XP_057766396.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:32647743`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B27
`Chr5:32647743`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B27
`Chr5:32647790`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C32
`Chr5:32649926`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B57,B83,C52,C84
`Chr5:32649971`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:32650244`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr5:32650269`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr5:32650849`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766395.1

505 aa

252

505

NHL

PF01436 NHL 135-161 aa

XP_057766396.1

487 aa

244

487

NHL

PF01436 NHL 135-161 aa

XP_057766397.1

480 aa

240

480

NHL

PF01436 NHL 135-161 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766395.1`	Pfam	`PF01436`	NHL	Repeat	135	161	1.2e-06	29.0	NHL repeat
`XP_057766396.1`	Pfam	`PF01436`	NHL	Repeat	135	161	1.1e-06	29.1	NHL repeat
`XP_057766397.1`	Pfam	`PF01436`	NHL	Repeat	135	161	1e-06	29.2	NHL repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XR_009089464.1
GGGATAACATTATAAAATTATTAAATTTGTAGATTTCAAGATTAGTGCGTGTGTGGTTTAATTCTATATGAAATAGTATCAGCCCGTTACTACTTTGAGTTACCGTAAAATCTCGAAATGAAAAATGAAATCAGAGAGCCAAAAAAGCAGAGTGAAAAAGCTGTTTGTGTCTGCCAGAAGCTGAAACAGTAATCAGTGTGCTCGAATCCATGGCTTAAAACTTCATTTTTGCAAGTTGAAAACCACAAAATCTTTCCCTA...

XM_057910412.1
ACATTATAAAATTATTAAATTTGTAGATTTCAAGATTAGTGCGTGTGTGGTTTAATTCTATATGAAATAGTATCAGCCCGTTACTACTTTGAGTTACCGTAAAATCTCGAAATGAAAAATGAAATCAGAGAGCCAAAAAAGCAGAGTGAAAAAGCTGTTTGTGTCTGCCAGAAGCTGAAACAGTAATCAGTGTGCTCGAATCCATGGCTTAAAACTTCATTTTTGCAAGTTGAAAACCACAAAATCTTTCCCTAGAGGAA...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130986879
ATGAGGTCGGCCCTCTTCTTCCTAGTTTTCTTACCTTTAATCGCCTTCATCTCTAACTTTGAAGCTCAAGCTGCACCTGCTGGGCCGTTGATAAAGCACCTGTCATCTCTTGTGAAATGGACTAGGTCCTCATCCAAAACACCCCACCAATCAGATGGTGGTAATGTGGTTCAGTTCGATGATGGTTATCTTGTTGAGACTGTGGTTGAGGGGAATGAACTCGGCGTTGTGCCGTACTCCATCCGCGTCTCCCAGGATGG...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057766395.1
MRSALFFLVFLPLIAFISNFEAQAAPAGPLIKHLSSLVKWTRSSSKTPHQSDGGNVVQFDDGYLVETVVEGNELGVVPYSIRVSQDGELFAVDAINSNIVRITPPLSQYSRARLVAGSFQGRTGHVDGKPTDARFSHPKGVTMDDKGNVYVADTSNLAIRKIGEAGVTTIAGGKSTVAGYRDGPSEDAKFSTDFDVVYVRPTCSLLVVDRGNAALRQISLSKEDCDYENSSFSPTDLLMVAGAILVGYVTCLLQQGLGSS...

XP_057766396.1
MRSALFFLVFLPLIAFISNFEAQAAPAGPLIKHLSSLVKWTRSSSKTPHQSDGGNVVQFDDGYLVETVVEGNELGVVPYSIRVSQDGELFAVDAINSNIVRITPPLSQYSRARLVAGSFQGRTGHVDGKPTDARFSHPKGVTMDDKGNVYVADTSNLAIRKIGEAGVTTIAGGKSTVAGYRDGPSEDAKFSTDFDVVYVRPTCSLLVVDRGNAALRQISLSKEDCDYENSSFSPTDLLMVAGAILVGYVTCLLQQGLGSS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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