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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002804`

染色体: Chr05 坐标: 32795307-32798300 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002804`
名称	SmilChr05G002804
描述	DNA-directed RNA polymerases II and V subunit 8A-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	32795307 - 32798300 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986889`
GeneID	`130986889`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986889`
原始查询	`SmilChr05G002804`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DNA-directed RNA polymerases II and V subunit 8A-like
产物	DNA-directed RNA polymerases II and V subunit 8A-like
Arabidopsis	`AT1G54250` (NRPB8A) RNA polymerase Rpb8 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841866] identity=45.8; qcov=1.01; evalue=7.04e-39; confidence=medium
Rice	`Os03g0845700` (OSJNBa0032G11.30) - identity=48.3; qcov=1.05; evalue=8.61e-43; confidence=medium
GO	GO:0003899 (DNA-directed RNA polymerase activity); GO:0005665 (RNA polymerase II, core complex); GO:0005666 (RNA polymerase III complex); GO:0005736 (RNA polymerase I complex); GO:0006351 (DNA-templated transcription)
KEGG	smil03020 (RNA polymerase - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil03420 (Nucleotide excision repair - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03870 (RNA_pol_Rpb8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986889

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057766407.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057766408.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057766407.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766408.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766408.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:32796788`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B38,B39,B69,C5,D6
`Chr5:32796788`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B38,B39,B69,C5,D6
`Chr5:32796792`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B9
`Chr5:32796792`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B9
`Chr5:32797686`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B57

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766407.1

169 aa

169

RNA_pol_Rpb8

PF03870 RNA_pol_Rpb8 34-168 aa

XP_057766408.1

142 aa

142

RNA_pol_Rpb8

PF03870 RNA_pol_Rpb8 7-141 aa

XP_057766409.1

142 aa

142

RNA_pol_Rpb8

PF03870 RNA_pol_Rpb8 7-141 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766407.1`	Pfam	`PF03870`	RNA_pol_Rpb8	Family	34	168	9.5e-38	130.2	RNA polymerase Rpb8
`XP_057766408.1`	Pfam	`PF03870`	RNA_pol_Rpb8	Family	7	141	5.2e-38	131.1	RNA polymerase Rpb8
`XP_057766409.1`	Pfam	`PF03870`	RNA_pol_Rpb8	Family	7	141	5.2e-38	131.1	RNA polymerase Rpb8

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910425.1
GATGAAGTAGATGTTTAATTTTATACACTACAAATAAGAAAGAAAATAAGAGACAAATCTCTAAAACCCTACATCGATTCTAACAGTCAAAAACCTTACCTCGCCGCCCTCGGCCACGCCCCAGGTCGCTAGTCACCCAGCAGAGTCGCTTGGCAATGGCCAATTTCTACTTTGATGAGATAATCAAGGTGGTCAAGATCGATAGCCAAGTAGTATATGACAAAGTTTCCAGGATAAATGCAACGAGTGAAGACAATGAT...

XM_057910426.1
TTTAATTTTATACACTACAAATAAGAAAGAAAATAAGAGACAAATCTCTAAAACCCTACATCGATTCTAACAGTCAAAAACCTTACCTCGCCGCCCTCGGCCACGCCCCAGGTCGCTAGTCACCCAGCAGAGTCGCTTGGTAAGCTTCTTTTTCTTGAATTTAGAATCAGATGTCTTTTACGTCCATTAATCAGTGTTGTGATCTTGCAATATGACATTTATTCGTGTGTTGTTGGTTTCGGCCAAAATTTAGAATCTTT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130986889
ATGTTCAATGCTTCAAAGAAATCAATTTTTATTTTAAAGTTCTTTCCAGGTTATAGTTATTTTATTTCTTTTTGGCAGGCAATGGCCAATTTCTACTTTGATGAGATAATCAAGGTGGTCAAGATCGATAGCCAAGTAGTATATGACAAAGTTTCCAGGATAAATGCAACGAGTGAAGACAATGATTATTTTATGGAACTAGATGTGCACACTGAGCTGTATCCTATGCTTCCCAACGAGAAATACAGGATGCTGATTTC...

LOC130986889
ATGGCCAATTTCTACTTTGATGAGATAATCAAGGTGGTCAAGATCGATAGCCAAGTAGTATATGACAAAGTTTCCAGGATAAATGCAACGAGTGAAGACAATGATTATTTTATGGAACTAGATGTGCACACTGAGCTGTATCCTATGCTTCCCAACGAGAAATACAGGATGCTGATTTCTAACACTCTTAATATGGATGGTTCAGTACAGGGGGAACCTAAATCACTTGCAGACAAATTTGAGTATGTGATGCATGGTCT...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057766407.1
MFNASKKSIFILKFFPGYSYFISFWQAMANFYFDEIIKVVKIDSQVVYDKVSRINATSEDNDYFMELDVHTELYPMLPNEKYRMLISNTLNMDGSVQGEPKSLADKFEYVMHGLLYKMAEAEGKTDGNDNVKVEVYISFGGLQLMLKGDPLKMHKFRVDQKLFLLLRKI

XP_057766408.1
MANFYFDEIIKVVKIDSQVVYDKVSRINATSEDNDYFMELDVHTELYPMLPNEKYRMLISNTLNMDGSVQGEPKSLADKFEYVMHGLLYKMAEAEGKTDGNDNVKVEVYISFGGLQLMLKGDPLKMHKFRVDQKLFLLLRKI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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