当前解析结果
SmilChr05G002808| 统一新 Gene ID | SmilChr05G002808 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G002808 |
| 描述 | pathogen-related protein |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 32886898 - 32897845 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130986894 |
|---|---|
| GeneID | 130986894 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130986894 |
| 原始查询 | SmilChr05G002808 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | pathogen-related protein |
| 产物 | pathogen-related protein |
| Arabidopsis | AT1G78780 (AT1G78780)pathosis-related family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844214] identity=73.3; qcov=1.02; evalue=1.14e-130; confidence=high |
| Rice | Os01g0731100- identity=61.8; qcov=0.877; evalue=1.09e-95; confidence=high |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130986894 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytosol | 细胞质基质 | 1.00000 | XP_057766416.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057766416.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057766416.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057766416.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057766416.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:32887343 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B107,B112,C28 |
Chr5:32891522 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B75 |
Chr5:32891551 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C14 |
Chr5:32891639 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B7,C11,C69 |
Chr5:32897689 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A13,C4 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。