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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002809`

染色体: Chr05 坐标: 32947059-32948402 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002809`
名称	SmilChr05G002809
描述	protein DOG1-like 4
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	32947059 - 32948402 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986895`
GeneID	`130986895`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986895`
原始查询	`SmilChr05G002809`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein DOG1-like 4
产物	protein DOG1-like 4
Arabidopsis	`AT3G14880` (AT3G14880) transcription factor-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820717] identity=50; qcov=0.903; evalue=9.71e-80; confidence=high
Rice	`Os05g0560200` (OsDOG1L-3) - identity=36.9; qcov=0.864; evalue=7.88e-42; confidence=medium
GO	GO:0006351 (DNA-templated transcription); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF14144 (DOG1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986895

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057766417.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057766417.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057766417.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766417.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766417.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:32947233`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C83
`Chr5:32947233`	`G`	`GC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C83
`Chr5:32947242`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr5:32947257`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B112,B140,B27,B64
`Chr5:32947261`	`C`	`CCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B57
`Chr5:32947261`	`C`	`CCA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B57
`Chr5:32947416`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B7,C11,C69
`Chr5:32947462`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:32947488`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,B27
`Chr5:32947497`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B22,B23,B41,C53
`Chr5:32947506`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,C19,C25
`Chr5:32947532`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B114,B33,B98

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766417.1

257 aa

128

257

DOG1

PF14144 DOG1 48-126 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766417.1`	Pfam	`PF14144`	DOG1	Family	48	126	8.3e-29	100.3	Seed dormancy control

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910434.1
GTTAATTTGGAAAGAGAAGATTAGTGATGTGAGCATATATTAAGATTTGCAGTTGAAGGTGTGGGAGGCAAGAAGGTTAGGTGTCAAAGAAAGAACGGCAAATAGTGTAATTGAACCACGCGGCATGAATTTCATGCAACGTGCCCTCCTCCCATCATTAAACATAACCCCCACGCCGACGCCCGAGTTTCACAACCACAAGCGTACCATGTCATCCTCCTTCCAGCGCTTCTACGATACGTGGTTGGAGCAGCTCCGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986895
ATGAATTTCATGCAACGTGCCCTCCTCCCATCATTAAACATAACCCCCACGCCGACGCCCGAGTTTCACAACCACAAGCGTACCATGTCATCCTCCTTCCAGCGCTTCTACGATACGTGGTTGGAGCAGCTCCGGCAGCTTGTGCAGCAGCTCCGGCAAGCCCCCGTGCCCCCCACCACCGAGGAGCAGCGGCAGCAGCTCCGGCAGCTGGTTCAGAAGGCCATCTCCCACTACGCGGAGTACTACCGGTCCAAGGCGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766417.1
MNFMQRALLPSLNITPTPTPEFHNHKRTMSSSFQRFYDTWLEQLRQLVQQLRQAPVPPTTEEQRQQLRQLVQKAISHYAEYYRSKAVGAKSDVLGFFSAPWTSTLERSLHWIGGWRPTTAFHLVYTESSILFESHVIDILRGYHTGDLGDLSPAQFRRVSELQIQTVQRENDITDQLCDWQDEATEIVGIRYAGVDVKMEKLAAILEKADELRMKTIKSLVELLTLQQAAEFLVAAADLQFGIRAWGIQQDRQRNHN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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