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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002810`

染色体: Chr05 坐标: 32983154-32987001 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002810`
名称	SmilChr05G002810
描述	tubby-like F-box protein 7
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	32983154 - 32987001 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986896`
GeneID	`130986896`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986896`
原始查询	`SmilChr05G002810`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	tubby-like F-box protein 7
产物	tubby-like F-box protein 7
Arabidopsis	`AT1G53320` (TLP7) tubby like protein 7 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841766] identity=66.8; qcov=0.896; evalue=3.97e-165; confidence=high
Rice	`Os05g0560400` (OsTLP11) - identity=64; qcov=0.869; evalue=4.02e-151; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF01167 (Tub)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986896

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057766418.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057766418.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057766418.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766418.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766418.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:32983756`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47
`Chr5:32983778`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr5:32983787`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B7,C11,C69
`Chr5:32984350`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B75,C31,C8
`Chr5:32984410`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B125
`Chr5:32986320`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,D10
`Chr5:32986494`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B53,C33,C78
`Chr5:32986568`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B7,C11,C69
`Chr5:32986666`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr5:32986698`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A13,C4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766418.1

383 aa

192

383

Tub

PF01167 Tub 118-378 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766418.1`	Pfam	`PF01167`	Tub	Domain	118	378	1.4e-92	310.8	Tub family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910435.1
GGGGGGGCATGCATCGACCGATTCATCGTCAAAATTAATTTGAGACAAGCGATAAACGGGCGATGTGTATGCTCCAGGTGAGGACTATCCCAAAAGAGGCTCCACCATTGAAGATTGTCTCCAGCTCCTCCAAATCTTTTTGGTCCCTTATATTTTATTAATATAAATATAATATAACTCAAAATAGGTGGACCTTTGGGATAGAATGCTTTTTGAGAGACGAGTCTTTGGACGAATTGGTTTGATATATGTCGACTCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986896
ATGTCATCCAAACTATCTTTTCTCCCGCGAAGAATCATTCATTCAGTCACCAAATCATGCAAACACCCTCAATTAAGCAGGAAAGAAGATGGTGCCGCTGATGATAACTGTCGTGATAGCGAGAGGGGGCGGCAGCACACCGCCATCGATGACTCCGATCTTTGGGCGGGGATGCTGCCGGAGCTTCTCGGGGAAATAATGCAGCGAGTTGAGGCCACCGAGGACCAATCGCCGCACCGCCAAAACGTCGTCGCATGCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766418.1
MSSKLSFLPRRIIHSVTKSCKHPQLSRKEDGAADDNCRDSERGRQHTAIDDSDLWAGMLPELLGEIMQRVEATEDQSPHRQNVVACACVCRQWREAAKEAAEKASIHHPGIITFPSSLKKAGPKDSLHQCLIKRDKKNAAFYLYLALTPSFTDNGKFLLAARKYRSGGRTEYVISLDESDLSQGSKSYVGKLRSDFLGTNFKIYDSQAPHSGAKSSSTRAGRRIGSKQISPQVPAGNFKVGTVSYKFNLLKSRGPRRMAC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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