当前解析结果
SmilChr05G002821| 统一新 Gene ID | SmilChr05G002821 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G002821 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G002821 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 33345258 - 33346387 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131025822 |
|---|---|
| GeneID | 131025822 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131025822 |
| 原始查询 | SmilChr05G002821 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0015074 (DNA integration) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131025822 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057811593.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057811593.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057811593.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057811593.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057811593.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:33345259 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B31,D11 |
Chr5:33345269 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C71 |
Chr5:33345322 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C38 |
Chr5:33345330 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A1,A20 |
Chr5:33345348 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B14 |
Chr5:33345370 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B77 |
Chr5:33345377 |
CCA |
C |
2bp_deletion | frameshift_variant | 92 | A10,A11,A14,A15,A19,A21,A23,A3,A5,B1,B10,B101,B102,B104,B111,B113,B115,B117,B121,B123,B124,B129,B130,B133,B137,B138,B17,B20,B22,B25,B31,B32,B35,B36,B37,B45,B46,B48,B49,B50,B53,B54,B55,B57,B60,B65,B68,B7,B80,B81,B88,B89,B9,B91,B94,B98,B99,C1,C17,C22,C26,C27,C30,C31,C32,C33,C36,C41,C42,C43,C44,C47,C5,C53,C54,C6,C60,C61,C62,C64,C66,C68,C76,C78,C80,C82,C86,C87,D10,D11,D4,D5 |
Chr5:33345388 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B14,B77 |
Chr5:33345390 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B14,C71 |
Chr5:33345398 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B9,C82,C86 |
Chr5:33345403 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 64 | A11,A15,A23,A3,A5,B1,B10,B101,B102,B113,B115,B121,B129,B130,B133,B134,B136,B137,B17,B20,B22,B25,B32,B35,B36,B37,B38,B39,B45,B48,B49,B50,B53,B54,B55,B57,B65,B68,B7,B89,B94,B98,B99,C22,C26,C30,C31,C32,C33,C36,C42,C43,C44,C6,C60,C61,C62,C68,C76,C78,C80,C87,D4,D5 |
Chr5:33345435 |
TTC |
T |
2bp_deletion | frameshift_variant | 1 | C38 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。