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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002848`

染色体: Chr05 坐标: 33953939-33967574 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002848`
名称	SmilChr05G002848
描述	mitochondrial inner membrane protease ATP23-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	33953939 - 33967574 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986921`
GeneID	`130986921`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986921`
原始查询	`SmilChr05G002848`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	mitochondrial inner membrane protease ATP23-like
产物	mitochondrial inner membrane protease ATP23-like
Arabidopsis	`AT3G03420` (AT3G03420) Ku70-binding family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821258] identity=72.6; qcov=0.459; evalue=4.85e-28; confidence=medium
Rice	`Os12g0288900` - identity=66.1; qcov=0.437; evalue=4.94e-24; confidence=low
GO	GO:0004222 (metalloendopeptidase activity); GO:0031314 (extrinsic component of mitochondrial inner membrane); GO:0033615 (mitochondrial proton-transporting ATP synthase complex assembly); GO:0034982 (mitochondrial protein processing)
KEGG	-
Pfam	PF09768 (Peptidase_M76)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986921

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	0.80000	`XP_057766471.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057766471.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057766471.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766471.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766471.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:33965464`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B2,B44,B67
`Chr5:33965469`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B107
`Chr5:33965469`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B107
`Chr5:33965655`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B105,B127,B44,C74
`Chr5:33965767`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766471.1

135 aa

135

Peptidase_M76

PF09768 Peptidase_M76 70-129 aa

XP_057766472.1

135 aa

135

Peptidase_M76

PF09768 Peptidase_M76 70-129 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766471.1`	Pfam	`PF09768`	Peptidase_M76	Family	70	129	4.7e-20	72.8	Peptidase M76 family
`XP_057766472.1`	Pfam	`PF09768`	Peptidase_M76	Family	70	129	4.7e-20	72.8	Peptidase M76 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

14 records

下载 cDNA FASTA

XR_009089480.1
TAAAACTATCCACTTTCATATTGTAAAGATAAAAATTGTCCACTAAGATAAAAATAATAAAAATTGTCCACTTTTTGATTGAAAAGACAGAAATACCCTTTACATTAAAATTTAAAAAAATGGCCACTTTCTCTAGCTCTCTTCCCTCGTCCTAATCGAATATGGAGAACAAAATTTCCAACTTGTAAAATCCCTAACTTCATCTCCTTCAATTTCCGGCGAAGACCACCGCTATCAGTCCGACGCCGTCGCCGCCGTAG...

XR_009089484.1
TAAAACTATCCACTTTCATATTGTAAAGATAAAAATTGTCCACTAAGATAAAAATAATAAAAATTGTCCACTTTTTGATTGAAAAGACAGAAATACCCTTTACATTAAAATTTAAAAAAATGGCCACTTTCTCTAGCTCTCTTCCCTCGTCCTAATCGAATATGGAGAACAAAATTTCCAACTTGTAAAATCCCTAACTTCATCTCCTTCAATTTCCGGCGAAGACCACCGCTATCAGTCCGACGCCGTCGCCGCCGTAG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130986921
ATGCTACTGATTCGTGGTATGTTGAACTTCATTCTTGATACAAGCAAGATAGAAGCTGGGAAGATGCAGCTTGAGGAGCAAGTGTTTGACGTGGAGCAGCTTCTGGAGGACGTGGTTGATCTATACTATCCTGCTGGCATGAATAAAGGCATAGACGTGATCTTGGATCCATGCGATGGCTCTGTCTCGAGATGTCGTTGGGCTATAGATGATCAGGTGGTGCAAGTGGTGATTCATGAGCTCGTTCGTGCTTATGATGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057766471.1
MLLIRGMLNFILDTSKIEAGKMQLEEQVFDVEQLLEDVVDLYYPAGMNKGIDVILDPCDGSVSRCRWAIDDQVVQVVIHELVRAYDECRAANLDWSNCAHHACNEIRANHLSGYCHLKQELLRGHLKIKKILSQY

XP_057766472.1
MLLIRGMLNFILDTSKIEAGKMQLEEQVFDVEQLLEDVVDLYYPAGMNKGIDVILDPCDGSVSRCRWAIDDQVVQVVIHELVRAYDECRAANLDWSNCAHHACNEIRANHLSGYCHLKQELLRGHLKIKKILSQY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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