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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002849`

染色体: Chr05 坐标: 33979117-33981217 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002849`
名称	SmilChr05G002849
描述	uncharacterized SmilChr05G002849
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	33979117 - 33981217 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986914`
GeneID	`130986914`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986914`
原始查询	`SmilChr05G002849`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OsSPEAR2; symbol=OsSPEAR2; hit=Os01g0212500; species=rice; confidence=weak
产物	OsSPEAR2; symbol=OsSPEAR2; hit=Os01g0212500; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os01g0212500` (OsSPEAR2) - identity=55.1; qcov=0.151; evalue=1.54e-09; confidence=weak
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity)
KEGG	-
Pfam	PF08744 (NOZZLE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986914

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057766449.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766449.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766449.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057766449.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057766449.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:33979761`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:33979872`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A6
`Chr5:33980145`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr5:33980195`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B74,B77,D3
`Chr5:33980445`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:33980489`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A23,B137,B45,C31

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766449.1

324 aa

162

324

NOZZLE

PF08744 NOZZLE 14-59 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766449.1`	Pfam	`PF08744`	NOZZLE	Family	14	59	9.5e-05	22.8	Plant transcription factor NOZZLE

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910466.1
GAAACAAAATCAAGAAGAAAATAAAAAGAGGAGAGAGAGTCGGTCTAATGATGGAAAATGAGGAATGGAGCGAGGATTTGGGCGAGAAATTAGATTGGGAGAGCATTCAAATAGGATGCTCTAGATTTACCTATAAGGTTTGAATTTCAAAAATTGAATCCAGGGATTGCATTTTTCTTCTCTCCGTTGTTTCACATACTCATCTCATATCTCTCAGACAACTGGGTTGGAGAAAAATCCGAATTCGAAAAGATACTCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986914
ATGGCCCCAGAAGAACAACACATTGTGAGCAGCACTCATAGCGGCGACAGATCCAGGAACGTTAAGCAGAAGAAAATCCCGCAGCGAGGGTTAGGCGTTGCGCAGCTTGAGAAAATCAGAGTGGAGGAGCAGAGGAAGAAGGAAACCGCCAATGCTCTGCCAAACAACGCCATCGCTTCGGCTACTGACGCAACTCTTTCGCCGTCGCCGGTCAATTTCCGATCACCATCGCTCCCAGTTCAGATGAATGGAAGCGTGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766449.1
MAPEEQHIVSSTHSGDRSRNVKQKKIPQRGLGVAQLEKIRVEEQRKKETANALPNNAIASATDATLSPSPVNFRSPSLPVQMNGSVEDAASWCRLWNGDYNHRNDNAAEFRPPVNLQSESNAALPQRFFRFQRPASPVVNPSSPSASSHMEPPSNQNMHNIHCNSYASSSSSWPEEYKMVGVKRSYPFSLESPPAGSFNGHFDPSSVASKSRRDELPSCGSGYAAVAARTEPRNVYMRDGPSNLPEDDGRLNGNFLTLAP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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