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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002851`

染色体: Chr05 坐标: 34006082-34007875 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002851`
名称	SmilChr05G002851
描述	30S ribosomal protein S6 alpha, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	34006082 - 34007875 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986918`
GeneID	`130986918`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986918`
原始查询	`SmilChr05G002851`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	30S ribosomal protein S6 alpha, chloroplastic-like
产物	30S ribosomal protein S6 alpha%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT1G64510` (AT1G64510) Translation elongation factor EF1B/ribosomal protein S6 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842759] identity=74.2; qcov=0.742; evalue=9.77e-73; confidence=high
Rice	`Os03g0843400` (OSJNBa0032G11.6) - identity=72; qcov=0.596; evalue=3.26e-57; confidence=medium
GO	GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0070181 (small ribosomal subunit rRNA binding)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01250 (Ribosomal_S6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986918

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057766465.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057766465.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057766465.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766465.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766465.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:34006361`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr5:34007353`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr5:34007423`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C18,C29,C72,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766465.1

198 aa

198

Ribosomal_S6

PF01250 Ribosomal_S6 93-191 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766465.1`	Pfam	`PF01250`	Ribosomal_S6	Domain	93	191	2.3e-16	60.5	Ribosomal protein S6

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910482.1
AAAATCATACTACAAAAACTATATTTGGATGGTTGAATGTGTTTGAGATTCCCATAGAAAAGTCGCGTTTGAGTAGAAACAAAGTCGCAGATAATTGGACCAACTCTACCTCCTTATCTACTGGAAATCACAGCTGCAGCTGCTCCCAATCCCAGCAACGATGGCTTCTTCTTCAGCTTCTCCACCGTCGTGTGCTCTCATGCTATCGAAGCCACCCCGCCACTCGTCCTTCACCTCTCTATCCGCCTTCACTTCCATCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986918
ATGGCTTCTTCTTCAGCTTCTCCACCGTCGTGTGCTCTCATGCTATCGAAGCCACCCCGCCACTCGTCCTTCACCTCTCTATCCGCCTTCACTTCCATCAAAATTAGAAGCCCGCAGGCGGCGGGAAGAGCGAGGACGACGCTCTCCGCCGTGAAAGCCGAGTTCGACCTTGCTTTCTTCGAGAGAGACTTGGAAGGGAGCGACGCGCCGCCGACGACGCCGGGCTTCCCCGAGGTGGAGGACAAGGAGGAGCCCCAGTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766465.1
MASSSASPPSCALMLSKPPRHSSFTSLSAFTSIKIRSPQAAGRARTTLSAVKAEFDLAFFERDLEGSDAPPTTPGFPEVEDKEEPQCPPGLRKYETMVVLRPDMSEDERLTFTQKYEELLVAGGGMYVEVFNRGVIPLAYSIKKKNKAGETNTYMDGIYLLFTYFTNPQSMTLLSDTLLADDDVVRSSSFKIRKRKLF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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