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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002858`

染色体: Chr05 坐标: 34085051-34086226 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002858`
名称	SmilChr05G002858
描述	uncharacterized SmilChr05G002858
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	34085051 - 34086226 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025830`
GeneID	`131025830`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025830`
原始查询	`SmilChr05G002858`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629]; symbol=AT2G01050; hit=AT2G01050; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629]; symbol=AT2G01050; hit=AT2G01050; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT2G01050` (AT2G01050) zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629] identity=48.9; qcov=0.148; evalue=1.81e-07; confidence=weak
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025830

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057811599.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057811599.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811599.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811599.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057811599.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:34085175`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B119,C63,C80
`Chr5:34085182`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B40,C39
`Chr5:34085205`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B119,C63,C80
`Chr5:34085223`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	86	A11,A16,A18,A4,A6,A7,A8,B10,B107,B108,B110,B113,B12,B120,B121,B126,B127,B128,B129,B130,B132,B134,B137,B14,B140,B16,B19,B2,B22,B23,B24,B25,B30,B31,B32,B33,B38,B39,B45,B46,B49,B50,B53,B57,B60,B66,B71,B72,B74,B78,B79,B84,B86,B9,B90,B92,B93,B95,C10,C12,C14,C19,C22,C24,C25,C26,C28,C3,C32,C35,C37,C38,C41,C49,C52,C53,C59,C6,C60,C68,C74,C75,C85,C86,D7,D9
`Chr5:34085317`	`TTA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	B123,B136,B21,C58
`Chr5:34085317`	`TTA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	4	B123,B136,B21,C58
`Chr5:34085335`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	89	A1,A11,A13,A18,A20,A21,A22,A24,A25,A3,A6,A8,B1,B100,B103,B104,B107,B115,B119,B126,B129,B133,B138,B140,B15,B18,B19,B2,B20,B23,B24,B29,B31,B34,B35,B36,B40,B47,B48,B5,B50,B52,B54,B57,B59,B60,B62,B65,B75,B8,B83,B86,B88,B91,B93,B94,B97,B99,C19,C29,C30,C31,C32,C34,C36,C4,C41,C45,C46,C49,C50,C54,C56,C59,C68,C7,C72,C73,C75,C76,C77,C79,C86,C87,C9,D2,D3,D6,D7
`Chr5:34085361`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	23	A10,B110,B118,B121,B123,B20,B29,B4,B44,B72,B77,C11,C16,C18,C29,C44,C46,C6,C72,C78,C79,C80,C83
`Chr5:34085597`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19
`Chr5:34085608`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr5:34085651`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr5:34085705`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D1,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955616.1
ATGGGCATTGCTCGTTATGTGGGACACCCGTTAAGGGTTGATGGAACTTCAGCAAAAAGAGACTTTGGCCAATTCGCCAGAATTCTTATCGAAATAGATATGTCTAAACCTTTGCCTAATACTCTTCTTGTTGATGGAGATGACGTTGCTTTTCATGTGGAATTTACATATAAATATCTCCCTTTTTTTGTTCCAGATGCAAAACAACAGGACATACTCTCGAGAAATGAGCCGCTGGATCAAAGCGTTGATCATGTTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025830
ATGGGCATTGCTCGTTATGTGGGACACCCGTTAAGGGTTGATGGAACTTCAGCAAAAAGAGACTTTGGCCAATTCGCCAGAATTCTTATCGAAATAGATATGTCTAAACCTTTGCCTAATACTCTTCTTGTTGATGGAGATGACGTTGCTTTTCATGTGGAATTTACATATAAATATCTCCCTTTTTTTGTTCCAGATGCAAAACAACAGGACATACTCTCGAGAAATGAGCCGCTGGATCAAAGCGTTGATCATGTTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811599.1
MGIARYVGHPLRVDGTSAKRDFGQFARILIEIDMSKPLPNTLLVDGDDVAFHVEFTYKYLPFFVPDAKQQDILSRNEPLDQSVDHVDLDKGSGFAIHETNLHERDISRSAESLRTPTRTDTVNGLEVLKKVNAMEIHCQDKVSPTAGRSTTSALEISKLNLGNRFEVLTSRGEQIDTEAYKQPVNLPDQEIETSEDEEEVDAEIIMESDGKFNEEDMEVPGLINERRILEATGAEAVAIENAMKAQRLEQILAIAKAPMK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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