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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002872`

染色体: Chr05 坐标: 34403037-34404380 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002872`
名称	SmilChr05G002872
描述	uncharacterized SmilChr05G002872
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	34403037 - 34404380 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025834`
GeneID	`131025834`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025834`
原始查询	`SmilChr05G002872`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859]; symbol=MUG7; hit=AT3G05850; species=arabidopsis; confidence=low
产物	MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859]; symbol=MUG7; hit=AT3G05850; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G05850` (MUG7) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859] identity=27.1; qcov=0.629; evalue=9.73e-34; confidence=low
Rice	`Os10g0104700` - identity=31.5; qcov=0.604; evalue=3.46e-27; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00872 (Transposase_mut); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025834

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057811602.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811602.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811602.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057811602.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057811602.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:34403085`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B103,B65,C49
`Chr5:34403095`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B130,C33
`Chr5:34403103`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B34,C35
`Chr5:34403103`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B34,C35
`Chr5:34403111`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A14,D10
`Chr5:34403123`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B47,C33
`Chr5:34403140`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B118,B34
`Chr5:34403169`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	22	A20,A4,B115,B19,B27,B58,B78,B88,B98,C13,C24,C26,C28,C34,C47,C50,C7,C70,C78,C82,C85,D7
`Chr5:34403175`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B12,B44,B86,C18
`Chr5:34403183`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B63,C25,C67
`Chr5:34403190`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	47	A14,A20,B10,B103,B108,B114,B12,B127,B14,B17,B19,B20,B27,B5,B50,B57,B67,B69,B75,B80,B83,B85,B89,B9,B91,B95,B98,C12,C14,C24,C39,C43,C44,C5,C50,C53,C58,C6,C63,C66,C72,C74,C78,C81,D3,D8,D9
`Chr5:34403232`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C28,C4,C52

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811602.1

447 aa

224

447

Transposase_mut

MULE

PF00872 Transposase_mut 370-446 aa PF10551 MULE 371-447 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811602.1`	Pfam	`PF00872`	Transposase_mut	Family	370	446	9.6e-05	22.1	Transposase, Mutator family
`XP_057811602.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	371	447	5.6e-13	49.8	MULE transposase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955619.1
ATGCTTTTCTACACATCGACCACGGACGAAGGGCGAAAAATAAAAGTGGCTTTGAAGACTGATTCGGATTTGAACCGGCTGATTTCCGAGCATAAGAAATATCCCGTTGTTTACGTGATCGAGAAGGGCAAACAATCTGCGGCTCCGGTTCCTCAAGAGCGGGTATATTATGAGGGACATCGGTCTACTATGTTTCCTATTGAGACGGACATTGGAAGAAGTATCCCTACACACGATGATAGTAGGGACGATTCATCGTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025834
ATGCTTTTCTACACATCGACCACGGACGAAGGGCGAAAAATAAAAGTGGCTTTGAAGACTGATTCGGATTTGAACCGGCTGATTTCCGAGCATAAGAAATATCCCGTTGTTTACGTGATCGAGAAGGGCAAACAATCTGCGGCTCCGGTTCCTCAAGAGCGGGTATATTATGAGGGACATCGGTCTACTATGTTTCCTATTGAGACGGACATTGGAAGAAGTATCCCTACACACGATGATAGTAGGGACGATTCATCGTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811602.1
MLFYTSTTDEGRKIKVALKTDSDLNRLISEHKKYPVVYVIEKGKQSAAPVPQERVYYEGHRSTMFPIETDIGRSIPTHDDSRDDSSSQEEEDESESSDEEEEAIRRREILDSVSTEQEAWRQTGPQNFTSDDQPDVEPRVGVQQLEARDWGIPVLDFDDAPALGWEDSNVLESGILSVGALFRSKDDLAIAVGLYHMENHVEYAVHRSSTTRLWFVCKHGNGCPFMLRAVQSASIWRVIKVVMDHTCHTDLNRTAPRQIP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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