当前解析结果
SmilChr05G002874| 统一新 Gene ID | SmilChr05G002874 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G002874 |
| 描述 | protein GRIM REAPER |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 34419084 - 34419848 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130986947 |
|---|---|
| GeneID | 130986947 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130986947 |
| 原始查询 | SmilChr05G002874 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | protein GRIM REAPER |
| 产物 | protein GRIM REAPER |
| Arabidopsis | AT1G53130 (GRI)Stigma-specific Stig1 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841747] identity=56.5; qcov=0.994; evalue=3.55e-52; confidence=high |
| Rice | Os01g0248000- identity=37; qcov=0.697; evalue=5.14e-14; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF04885 (Stig1) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130986947 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Secreted | 分泌到胞外 | 1.00000 | XP_057766484.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057766484.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057766484.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057766484.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057766484.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057766484.1PF04885
Stig1 67-155 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057766484.1 |
Pfam | PF04885 |
Stig1 | Family | 67 | 155 | 5.4e-23 | 82.0 | Stigma-specific STIG1-like protein family |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。