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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002901`

染色体: Chr05 坐标: 34867111-34868145 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002901`
名称	SmilChr05G002901
描述	uncharacterized SmilChr05G002901
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	34867111 - 34868145 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025841`
GeneID	`131025841`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025841`
原始查询	`SmilChr05G002901`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os10g0351414; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os10g0351414; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os10g0351414` - identity=24.6; qcov=0.91; evalue=7.49e-16; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03372 (Exo_endo_phos)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025841

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057811609.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057811609.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057811609.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811609.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811609.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:34867127`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	94	A10,A11,A15,A23,A25,A3,A5,A6,B101,B102,B105,B107,B110,B119,B120,B121,B127,B132,B134,B135,B137,B138,B139,B14,B17,B18,B2,B23,B25,B27,B28,B33,B38,B39,B42,B43,B44,B45,B48,B5,B50,B52,B53,B54,B55,B63,B65,B68,B70,B71,B72,B73,B74,B8,B83,B91,B95,B97,C15,C16,C2,C21,C29,C3,C31,C32,C34,C35,C36,C37,C38,C4,C40,C44,C45,C48,C5,C52,C59,C61,C63,C65,C68,C7,C70,C73,C74,C79,C8,C83,D2,D3,D4,D6
`Chr5:34867133`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C42,D8
`Chr5:34867143`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:34867153`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C42,C86
`Chr5:34867174`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B72
`Chr5:34867174`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr5:34867175`	`GAC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	74	A11,A2,A22,A24,A5,B1,B10,B100,B101,B104,B107,B11,B111,B115,B12,B122,B123,B128,B130,B133,B135,B136,B138,B14,B18,B19,B21,B32,B36,B4,B49,B5,B53,B54,B59,B60,B62,B66,B76,B77,B79,B85,B86,B88,B95,B99,C12,C14,C18,C19,C22,C25,C26,C33,C43,C44,C47,C48,C49,C52,C57,C58,C6,C61,C62,C69,C71,C72,C78,C80,C85,C87,D5,D8
`Chr5:34867179`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	72	A16,A2,A22,A24,A5,B1,B10,B100,B101,B104,B105,B107,B11,B111,B115,B12,B122,B123,B128,B130,B133,B135,B136,B138,B14,B19,B21,B32,B36,B4,B5,B53,B54,B59,B60,B62,B66,B71,B76,B77,B79,B85,B86,B88,B89,B95,B99,C12,C14,C18,C19,C33,C43,C44,C47,C48,C49,C52,C57,C58,C6,C61,C62,C69,C71,C72,C78,C80,C85,C87,D5,D8
`Chr5:34867185`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B22,B77,C59,D3
`Chr5:34867193`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B73,C21,C31
`Chr5:34867194`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A23,B137,B37,B45,C31
`Chr5:34867202`	`T`	`TAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	19	A1,A9,B118,B119,B125,B126,B15,B51,B65,B67,B86,B99,C19,C39,C4,C44,C65,C66,C81

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811609.1

344 aa

172

344

Exo_endo_phos

PF03372 Exo_endo_phos 6-224 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811609.1`	Pfam	`PF03372`	Exo_endo_phos	Domain	6	224	9.7e-06	26.2	Endonuclease/Exonuclease/phosphatase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955626.1
ATGAATGTTATATGCTGGAATGCTCGGGGGTTGGGGAGCTCCCGGGCATTCCATGAGTTACGCCGACTTGTCTCCGGCTACTCCCCATGTCTGTTGCTCATCTGTGAGAGAAAGGTTAATGCTTGTAAGGCCAACTGGTGGAGATCTTCTTTACATTTTGATGGACAATTCGTTGTAGATTCTAAAGGCGCTAGTGGGGGCCTTATTTTGTTTTGGAAACATCCTTGCTCTGCTTCTATTAGTAGTTTCTCTCAAGGACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025841
ATGAATGTTATATGCTGGAATGCTCGGGGGTTGGGGAGCTCCCGGGCATTCCATGAGTTACGCCGACTTGTCTCCGGCTACTCCCCATGTCTGTTGCTCATCTGTGAGAGAAAGGTTAATGCTTGTAAGGCCAACTGGTGGAGATCTTCTTTACATTTTGATGGACAATTCGTTGTAGATTCTAAAGGCGCTAGTGGGGGCCTTATTTTGTTTTGGAAACATCCTTGCTCTGCTTCTATTAGTAGTTTCTCTCAAGGACA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811609.1
MNVICWNARGLGSSRAFHELRRLVSGYSPCLLLICERKVNACKANWWRSSLHFDGQFVVDSKGASGGLILFWKHPCSASISSFSQGHIDCVVEYNDVVWRFIGFYGNPKVQNRKHSWSLMKKLACSGIMDAPWLMGGDFNEVTKSDDCCYWCRRPWAQMSEFNNAIQFCGFKSVPCDSNFTWYNQRKEVDARFLKLDRFLCNRLMEDKFTLSTVRALDPHCSDHNPLLLSFSVRADNLVPGKGFKRFFFEQKWLLDKHFA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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