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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002904`

染色体: Chr05 坐标: 34889845-34890957 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002904`
名称	SmilChr05G002904
描述	photosynthetic NDH subunit of lumenal location 3, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	34889845 - 34890957 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986974`
GeneID	`130986974`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986974`
原始查询	`SmilChr05G002904`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	photosynthetic NDH subunit of lumenal location 3, chloroplastic
产物	photosynthetic NDH subunit of lumenal location 3%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT3G01440` (PnsL3) PsbQ-like 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821143] identity=56.7; qcov=0.877; evalue=2.3e-66; confidence=high
Rice	`Os07g0105600` (P0446F04.140) - identity=49.7; qcov=0.901; evalue=2.87e-49; confidence=medium
GO	GO:0005509 (calcium ion binding); GO:0009507 (chloroplast); GO:0009523 (photosystem II); GO:0009654 (photosystem II oxygen evolving complex); GO:0009767 (photosynthetic electron transport chain); GO:0015979 (photosynthesis); GO:0019898 (extrinsic component of membrane); GO:0045156 (GO:0045156)
KEGG	smil00195 (Photosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF05757 (PsbQ)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986974

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057766507.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057766507.1`
3	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	1.00000	`XP_057766507.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057766507.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766507.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:34890083`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,B69,C4,C5
`Chr5:34890117`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,C60,C62,C82
`Chr5:34890125`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B112,B40,B91,C35
`Chr5:34890362`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A1,C42,D8
`Chr5:34890491`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,A23,C76
`Chr5:34890740`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B22,B74,B77,C59,D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766507.1

203 aa

102

203

PsbQ

PF05757 PsbQ 32-203 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766507.1`	Pfam	`PF05757`	PsbQ	Family	32	203	3.8e-49	168.3	Oxygen evolving enhancer protein 3

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910524.1
GACATTATAAGAGAGACGGATGGAGTATTATTTATTAGTAGCATGAGTAACAACCGTGGCAGTGAAGGAATTTTACGGATATAGCATGAGTGGACAGGACAGTCGTAGCGCTACAACGGATATGGCATAAGCTACTCTGTATCACCAAAACAAAACCATTCTTCACTTAGAAACCAGTTATGGCGACTACACCTAATCTCAACGGCGCCCTCCCCGCCGTTATAAAGCTTGGCGGCGTCGAAAAGCCACGGCCAAGCGGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986974
ATGGCGACTACACCTAATCTCAACGGCGCCCTCCCCGCCGTTATAAAGCTTGGCGGCGTCGAAAAGCCACGGCCAAGCGGGAACGATCTCCGGGCAACAAGGAGAGTCGCCATTGGGCTGGCCTCGATTACACTCGTAGCAAATGCCGCCACCGGAGCCTCAGTCGCCCAAGACAACGGGTTTTGGATCGAGGGCCCCATACCAGTGCCATACGCCAACAACAAAATCGACAATGAAGAGACGGGGACGCGGTCGTTCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766507.1
MATTPNLNGALPAVIKLGGVEKPRPSGNDLRATRRVAIGLASITLVANAATGASVAQDNGFWIEGPIPVPYANNKIDNEETGTRSFLKKGIYIANIGTKGRMQRLRRYAFDLLAMADLIAQEDAWNYVRRYLRLKSTFMYFDFDRVISAAPLDDKEPLMDLANRLFDSFEKLLEAVRKQDVPQIYSRYQATTPLLQEVMARMA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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