Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID,以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因,再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。
示例

当前解析结果

SmilChr05G002916

染色体: Chr05 坐标: 35121746-35124169 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene IDSmilChr05G002916
名称SmilChr05G002916
描述uncharacterized SmilChr05G002916
染色体 / SeqIDChr05 / NC_080391.1
坐标与链方向35121746 - 35124169 / -

ID 对照

NCBI Gene IDLOC130986985
GeneID130986985
locus_tag-
NCBI NameLOC130986985
原始查询SmilChr05G002916

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=low
产物hit=Os06g0523701; species=rice; confidence=low
Arabidopsis-
-
RiceOs06g0523701
-
identity=34.1; qcov=0.455; evalue=6.9e-41; confidence=low
GOGO:0003676 (nucleic acid binding)
KEGG-
Pfam-
InterPro-
eggNOG-
NRGeneID:130986985

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank定位位置中文ScoreProtein ID
1 Nucleus 细胞核 1.00000 XP_057766516.1
2 Chromosome 染色体 0.20000 XP_057766516.1
3 Centromere 着丝粒 0.00000 XP_057766516.1
4 Chromatin 染色质 0.00000 XP_057766516.1
5 Telomere 端粒 0.00000 XP_057766516.1

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变,或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中,此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA(仅基因区域)

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA
XM_057910533.1
ATGGCTAGGAGAAAAGATCTCTCCACATTTGAGAGGGCAGCAATAATCCAATTCCTCCTTGAAGACAGCAAGGAAGGGAAGCCTGCTAGAGGGAAGATTTCAGCAGCTGTTGCAAAATGGAGCAGCTCACGAAGCACAATCAATCGGGTATGGGCAGCTGCAAAAAAGCAAATACAGAAGGGTGAGGTAATATGTTCCATGAGTCGAAAAATACAAAGACCAAGACAAAAGAGAGTGCAATTAGATTTACAGTTAATTGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA
LOC130986985
ATGGCTAGGAGAAAAGATCTCTCCACATTTGAGAGGGCAGCAATAATCCAATTCCTCCTTGAAGACAGCAAGGAAGGGAAGCCTGCTAGAGGGAAGATTTCAGCAGCTGTTGCAAAATGGAGCAGCTCACGAAGCACAATCAATCGGGTATGGGCAGCTGCAAAAAAGCAAATACAGAAGGGTGAGGTAATATGTTCCATGAGTCGAAAAATACAAAGACCAAGACAAAAGAGAGTGCAATTAGATTTACAGTTAATTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA
XP_057766516.1
MARRKDLSTFERAAIIQFLLEDSKEGKPARGKISAAVAKWSSSRSTINRVWAAAKKQIQKGEVICSMSRKIQRPRQKRVQLDLQLIANLDLSKRSTIRRLACGIQCSKSTVGRWIKLGLIKAHSNAIKPDLTAPNKLLRLRFSLEALEYDRIMRSVTFKNMHNTIHIDEKWFYITKTNQRFYLTPAESEPHRTCKSKKFITKVMFMCAVCRPIFGPDGECIFDGKIGIFPFTELVPAKRKSKNRAAGTMEWKPIQSITKE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

JBrowse

跳转到基因组浏览器