当前解析结果
SmilChr05G002925| 统一新 Gene ID | SmilChr05G002925 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G002925 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G002925 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 35234714 - 35235830 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131025846 |
|---|---|
| GeneID | 131025846 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131025846 |
| 原始查询 | SmilChr05G002925 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | GO:0003676 (nucleic acid binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131025846 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057811614.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057811614.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057811614.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057811614.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057811614.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:35234718 |
AG |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 7 | A13,B16,B79,C23,C26,C58,D4 |
Chr5:35234740 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B14,B26,B64 |
Chr5:35234750 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B74,B91,C59,D3 |
Chr5:35234769 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B110,B93 |
Chr5:35234771 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B15 |
Chr5:35234773 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B100,C24,C3,D7 |
Chr5:35234808 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B108,B110,B122,B93 |
Chr5:35234814 |
TC |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 28 | A18,B118,B124,B131,B134,B136,B19,B32,B41,B46,B51,B53,B58,B65,B70,B79,B83,B84,C10,C18,C25,C26,C29,C45,C52,C72,C84,D2 |
Chr5:35234817 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A2,C60,C62,C82 |
Chr5:35234840 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C71 |
Chr5:35234868 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A24,B108,B110,B122,B93 |
Chr5:35234876 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A24 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。