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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002931`

染色体: Chr05 坐标: 35351421-35353264 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002931`
名称	SmilChr05G002931
描述	60S ribosomal protein L8
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	35351421 - 35353264 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130986998`
GeneID	`130986998`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130986998`
原始查询	`SmilChr05G002931`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	60S ribosomal protein L8
产物	60S ribosomal protein L8
Arabidopsis	`AT4G36130` (AT4G36130) Ribosomal protein L2 family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829770] identity=92.6; qcov=0.992; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0567700` (rpl2) - identity=92.8; qcov=0.958; evalue=2.71e-176; confidence=high
GO	GO:0002181 (cytoplasmic translation); GO:0003723 (RNA binding); GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0022625 (cytosolic large ribosomal subunit)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00181 (Ribosomal_L2_N); PF03947 (Ribosomal_L2_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130986998

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057766534.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057766534.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057766534.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766534.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766534.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:35351565`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B110,D1
`Chr5:35351666`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B28,B36,B66,B76,C14
`Chr5:35351669`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C29,C79
`Chr5:35352713`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B53,C33,C78
`Chr5:35352786`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B135,B66
`Chr5:35352828`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766534.1

260 aa

130

260

Ribosomal_L2_N

Ribosomal_L2_C

PF00181 Ribosomal_L2_N 2-90 aa PF03947 Ribosomal_L2_C 98-224 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766534.1`	Pfam	`PF00181`	Ribosomal_L2_N	Domain	2	90	1e-23	83.9	Ribosomal Proteins L2, RNA binding N-terminal domain
`XP_057766534.1`	Pfam	`PF03947`	Ribosomal_L2_C	Domain	98	224	1.9e-45	154.7	Ribosomal Proteins L2, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910551.1
AAATTGGGCCGGGCCCATGTGTGACCATCTCAGAACAATCCATGCGGAAACCCTAATTTCAGCGGAGAAGAACTTCCCCTAAAACCCTATATCTATCTATACCACTTCTCTTCCTTCATTTCTCCTCCCGCCGCTCTCCTCCTCCTGTTTCACACACACACACTGAGCACGCCGGCAGAATGGGACGTGTGATTAGAGCGCAGCGTAAGGGAGCGGGTTCCGTCTTCAAATCCCACACCCACCACCGCAAGGGACCGGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130986998
ATGGGACGTGTGATTAGAGCGCAGCGTAAGGGAGCGGGTTCCGTCTTCAAATCCCACACCCACCACCGCAAGGGACCGGCGCGCTTCCGCACCCTCGACTTCGGCGAACGTAACGGCTACCTCAAGGGTGTCGTCACCGAGATCATCCACGACCCCGGCCGCGGCGCTCCCCTCGCTCGCGTCACCTTCCGCCACCCCTTCCGCTTCCAGCACCAGAAGGAACTCTTCGTCGCCGCCGAGGGTATGTACACCGGCCAGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766534.1
MGRVIRAQRKGAGSVFKSHTHHRKGPARFRTLDFGERNGYLKGVVTEIIHDPGRGAPLARVTFRHPFRFQHQKELFVAAEGMYTGQFVYCGKKANLVVGNVLPLRSIPEGAVVCNVEHHVGDRGVFARASGDYAIVISHNPDNGTTRVKLPSGAKKIVPSGCRAMVGQVAGGGRTEKPMLKAGNAYHKFRVKRNSWPKVRGVAMNPVEHPHGGGNHQHIGHASTVRRDAPPGQKVGLIAARRTGRLRGQAAATAAKADKA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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