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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002941`

染色体: Chr05 坐标: 35458863-35462772 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002941`
名称	SmilChr05G002941
描述	uncharacterized SmilChr05G002941
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	35458863 - 35462772 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987005`
GeneID	`130987005`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987005`
原始查询	`SmilChr05G002941`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os07g0506000; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os07g0506000; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G21570` (AT4G21570) organic solute transporter ostalpha protein (DUF300) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828242] identity=72; qcov=0.986; evalue=3.24e-150; confidence=high
Rice	`Os07g0506000` - identity=73.8; qcov=1; evalue=9.53e-162; confidence=high
GO	GO:0005215 (transporter activity); GO:0006810 (transport)
KEGG	-
Pfam	PF03619 (Solute_trans_a)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987005

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole membrane	液泡膜	0.80000	`XP_057766537.1`
2	Golgi apparatus	高尔基体	0.60000	`XP_057766537.1`
3	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057766537.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057766537.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766537.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:35460516`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C9
`Chr5:35461447`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B110
`Chr5:35461461`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,B21,B58
`Chr5:35461470`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr5:35461575`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B132,B17,C32,C68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766537.1

290 aa

145

290

Solute_trans_a

PF03619 Solute_trans_a 9-275 aa

XP_057766539.1

290 aa

145

290

Solute_trans_a

PF03619 Solute_trans_a 9-275 aa

XP_057766540.1

290 aa

145

290

Solute_trans_a

PF03619 Solute_trans_a 9-275 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766537.1`	Pfam	`PF03619`	Solute_trans_a	Family	9	275	1.4e-74	251.5	Organic solute transporter Ostalpha
`XP_057766539.1`	Pfam	`PF03619`	Solute_trans_a	Family	9	275	1.4e-74	251.5	Organic solute transporter Ostalpha
`XP_057766540.1`	Pfam	`PF03619`	Solute_trans_a	Family	9	275	1.4e-74	251.5	Organic solute transporter Ostalpha

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910554.1
GACTTTTCACCTAACACTCAAACCATACGATCAACGAGTCCAATGACGACAACTTACATCAAATGAACTCCCACAGCCTCGCCCATTCCTTTTCCTTTTTAACGTAATTCCTTTATTTATTATTACGTGTATAAAATTGAAATTTACTATGGAGTATATATTTACATACTACTAGAGTCAAGACTTGCCAATCACTGGCTTCATTGTGGAAGCAGAAAACACGCTCAACTAATCTTCTTCTTGATTTCTCCCCCTTCTCC...

XM_057910556.1
AACCATACGATCAACGAGTCCAATGACGACAACTTACATCAAATGAACTCCCACAGCCTCGCCCATTCCTTTTCCTTTTTAACGTAATTCCTTTATTTATTATTACGTGTATAAAATTGAAATTTACTATGGAGTATATATTTACATACTACTAGAGTCAAGACTTGCCAATCACTGGCTTCATTGTGGAAGCAGAAAACACGCTCAACTAATCTTCTTCTTGATTTCTCCCCCTTCTCCGATCACGGTTTACTTAAAAT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130987005
ATGGATCGTGGGAAATTTACACTGATGGGATCGACTGTGTGTGTCATGCTCAGTTTGCACTTCTCGATACAGCTAGTGTCCCAACATTATCTAGCATGGAAGAAGCCCAAGGAACAAAAGGCGATTGTCATAATTGTCCTCATGGCTCCCTTATATGCTATTGACTCTTATGTTGGTCTGTTGGATATCAAAGGAAGTGAAACATTTTTCACTTTCTTGGATTCTGTAAAAGAATGTTATGAGGCTCTGGTGATGGCAAA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057766537.1
MDRGKFTLMGSTVCVMLSLHFSIQLVSQHYLAWKKPKEQKAIVIIVLMAPLYAIDSYVGLLDIKGSETFFTFLDSVKECYEALVMAKFLSLMYTYLNISISKNIVPDEIKGREIHHSFPMTLFQPHTVRLDHKNLKLLKDWTLQFVVIRPVCSVLMITFQLLDIYPSWLSWTFTIILNVSVSLALYSLVVFYHVFAKELAPHKPLAKFLCVKGIVFFCFWQGIMLDILVAVGIIKSNHFWLDVEHLQGALQNVLVIVEMV...

XP_057766539.1
MDRGKFTLMGSTVCVMLSLHFSIQLVSQHYLAWKKPKEQKAIVIIVLMAPLYAIDSYVGLLDIKGSETFFTFLDSVKECYEALVMAKFLSLMYTYLNISISKNIVPDEIKGREIHHSFPMTLFQPHTVRLDHKNLKLLKDWTLQFVVIRPVCSVLMITFQLLDIYPSWLSWTFTIILNVSVSLALYSLVVFYHVFAKELAPHKPLAKFLCVKGIVFFCFWQGIMLDILVAVGIIKSNHFWLDVEHLQGALQNVLVIVEMV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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