当前解析结果
SmilChr05G002942| 统一新 Gene ID | SmilChr05G002942 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G002942 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G002942 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 35487334 - 35490090 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130987006 |
|---|---|
| GeneID | 130987006 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130987006 |
| 原始查询 | SmilChr05G002942 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF09331 (DUF1985); PF29561 (DUF8566) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130987006 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057766541.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057766541.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057766541.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057766541.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057766541.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057766541.1PF29561
DUF8566 59-236 aa
PF09331
DUF1985 81-215 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057766541.1 |
Pfam | PF29561 |
DUF8566 | Domain | 59 | 236 | 1.1e-09 | 39.1 | Domain of unknown function (DUF8566) |
XP_057766541.1 |
Pfam | PF09331 |
DUF1985 | Family | 81 | 215 | 2.6e-12 | 47.6 | Domain of unknown function (DUF1985) |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。