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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002947`

染色体: Chr05 坐标: 35517683-35524879 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002947`
名称	SmilChr05G002947
描述	uncharacterized SmilChr05G002947
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	35517683 - 35524879 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987009`
GeneID	`130987009`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987009`
原始查询	`SmilChr05G002947`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0636300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os04g0636300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os04g0636300` - identity=71; qcov=0.335; evalue=1.83e-62; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF01053 (Cys_Met_Meta_PP); PF06838 (Met_gamma_lyase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987009

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057766545.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057766545.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057766545.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766545.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766545.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:35517763`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B127,D1,D2
`Chr5:35517797`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,B103,C12,C57
`Chr5:35517877`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B74,B77,C59
`Chr5:35518810`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr5:35519390`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr5:35519411`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr5:35519924`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B104
`Chr5:35519924`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr5:35520810`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B74,B75,B77,C59,D6
`Chr5:35522989`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	31	A10,A15,B101,B105,B111,B114,B123,B132,B137,B28,B32,B50,B60,B66,B71,B72,B79,B88,B99,C1,C11,C14,C17,C22,C37,C49,C5,C76,C82,C86,D9
`Chr5:35522997`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr5:35523020`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B77,C59

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766545.1

510 aa

255

510

Met_gamma_lyase

PF06838 Met_gamma_lyase 56-445 aa

XP_057766546.1

458 aa

229

458

Met_gamma_lyase

Cys_Met_Meta_PP

PF06838 Met_gamma_lyase 56-456 aa PF01053 Cys_Met_Meta_PP 99-301 aa

XP_057766547.1

412 aa

206

412

Met_gamma_lyase

Cys_Met_Meta_PP

PF06838 Met_gamma_lyase 56-409 aa PF01053 Cys_Met_Meta_PP 99-301 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766545.1`	Pfam	`PF06838`	Met_gamma_lyase	Domain	56	445	3e-162	540.6	Methionine gamma-lyase
`XP_057766546.1`	Pfam	`PF06838`	Met_gamma_lyase	Domain	56	456	1.2e-164	548.4	Methionine gamma-lyase
`XP_057766546.1`	Pfam	`PF01053`	Cys_Met_Meta_PP	Domain	99	301	1.4e-06	27.9	Cys/Met metabolism PLP-dependent enzyme
`XP_057766547.1`	Pfam	`PF06838`	Met_gamma_lyase	Domain	56	409	4.3e-143	477.4	Methionine gamma-lyase
`XP_057766547.1`	Pfam	`PF01053`	Cys_Met_Meta_PP	Domain	99	301	1.1e-06	28.3	Cys/Met metabolism PLP-dependent enzyme

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XR_009089535.1
TAAACGGCACAGTACTCAGGTTGAGAGGTAGAGTGTGGGATACGATACCAGCAAAGAAATGTGTATGCTCTTATCCTCCACCACCACTTCTACTTTCCCGACGCCAACTTTCCGCTTAACCCGCGCCTCAGTAGCTTTTCCCGGTGCCACAGTTCCAGTGCGCTCAAGGCCATGGGCCTCGGCTCTTTCTGTCCACTGCGATGACCAGCCATTCGTACCGGAGGTTGAGAAAGCGGTGGACTCGTTGTACTCGGAGTTCC...

XM_057910562.1
TCTAAACGGCACAGTACTCAGGTTGAGAGGTAGAGTGTGGGATACGATACCAGCAAAGAAATGTGTATGCTCTTATCCTCCACCACCACTTCTACTTTCCCGACGCCAACTTTCCGCTTAACCCGCGCCTCAGTAGCTTTTCCCGGTGCCACAGTTCCAGTGCGCTCAAGGCCATGGGCCTCGGCTCTTTCTGTCCACTGCGATGACCAGCCATTCGTACCGGAGGTTGAGAAAGCGGTGGACTCGTTGTACTCGGAGTT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130987009
ATGTGTATGCTCTTATCCTCCACCACCACTTCTACTTTCCCGACGCCAACTTTCCGCTTAACCCGCGCCTCAGTAGCTTTTCCCGGTGCCACAGTTCCAGTGCGCTCAAGGCCATGGGCCTCGGCTCTTTCTGTCCACTGCGATGACCAGCCATTCGTACCGGAGGTTGAGAAAGCGGTGGACTCGTTGTACTCGGAGTTCCGAGCGGTAGATAATTTGGTGGCACGCAACTCGGGGCGCGTGCTTAAGGCTTTTCAGAA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057766545.1
MCMLLSSTTTSTFPTPTFRLTRASVAFPGATVPVRSRPWASALSVHCDDQPFVPEVEKAVDSLYSEFRAVDNLVARNSGRVLKAFQNARVGSHHFGGSTGYGHEESGGREALDQAFAEIFGAESAIVRAQFFSGTHAITCALFAFLRPGDELLAVAGAPYDTLEEVIGIRDSNGLGSLRDFGVDYREVPLSEDGGLDWAALKIALKPQTKCALIQRSCGYSWRRSLSVEEIGRAIEIIKVQNPHCLVMVDNCYGEFTERI...

XP_057766546.1
MCMLLSSTTTSTFPTPTFRLTRASVAFPGATVPVRSRPWASALSVHCDDQPFVPEVEKAVDSLYSEFRAVDNLVARNSGRVLKAFQNARVGSHHFGGSTGYGHEESGGREALDQAFAEIFGAESAIVRAQFFSGTHAITCALFAFLRPGDELLAVAGAPYDTLEEVIGIRDSNGLGSLRDFGVDYREVPLSEDGGLDWAALKIALKPQTKCALIQRSCGYSWRRSLSVEEIGRAIEIIKVQNPHCLVMVDNCYGEFTERI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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