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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002950`

染色体: Chr05 坐标: 35566703-35568408 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002950`
名称	SmilChr05G002950
描述	uncharacterized SmilChr05G002950
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	35566703 - 35568408 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987012`
GeneID	`130987012`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987012`
原始查询	`SmilChr05G002950`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cotton fiber (DUF761) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842420]; symbol=AT1G61260; hit=AT1G61260; species=arabidopsis; confidence=low
产物	cotton fiber (DUF761) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842420]; symbol=AT1G61260; hit=AT1G61260; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G61260` (AT1G61260) cotton fiber (DUF761) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842420] identity=34.8; qcov=1.23; evalue=1.73e-42; confidence=low
Rice	`Os07g0563400` (OJ1720_F04.106) - identity=52.7; qcov=0.529; evalue=4.42e-35; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05553 (DUF761); PF14364 (DUF4408)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987012

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057766550.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057766550.1`
3	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057766550.1`
4	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057766550.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057766550.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:35567219`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,A3,C74
`Chr5:35568063`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A23,B22,B50,B65
`Chr5:35568208`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766550.1

280 aa

140

280

DUF4408

DUF761

PF14364 DUF4408 36-68 aa PF05553 DUF761 245-280 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766550.1`	Pfam	`PF14364`	DUF4408	Family	36	68	3.4e-13	49.8	Domain of unknown function (DUF4408)
`XP_057766550.1`	Pfam	`PF05553`	DUF761	Family	245	280	1.5e-15	57.2	Cotton fibre expressed protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910567.1
AGAGTATCAAATTCCTATCGCCCCCGACCTTTAAAAACCAGCCAACCCCCACTCTCCTCTCTTCTCTCGAACACACACTCAGCCAACAGTTGCCCAAAATTCCATTCTCCGATAAATATAACTTATGTCGACATCAAGTAATATGCTGTCCGTTAAAGTCGTGTTTATATCCACGAGCGTTTTATCAGCTGCAATCATGCTAAGCACCACCGATATCGCCGTTTACGCACCCTGGATCTACAATGGCGTCGTTTCGTGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987012
ATGTCGACATCAAGTAATATGCTGTCCGTTAAAGTCGTGTTTATATCCACGAGCGTTTTATCAGCTGCAATCATGCTAAGCACCACCGATATCGCCGTTTACGCACCCTGGATCTACAATGGCGTCGTTTCGTGGCTACGACCTCCGTATCTGTACCTCGTTATCAACTGCATCATCATCACCATCGTCGCTTCCTCCAAACTCCAGTTGGCGACCGACGACGTGCCAATTGCGCCGCCGTTGGACGCCGTGCAGCAGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766550.1
MSTSSNMLSVKVVFISTSVLSAAIMLSTTDIAVYAPWIYNGVVSWLRPPYLYLVINCIIITIVASSKLQLATDDVPIAPPLDAVQQPAEISQPDFLSLAAEYKYDGAEKGLESDALDSGGSNESENSISSGADAADDDAMCNKENECVVVATAAENNDATDFVKPPASARFSHRRNFKSSPEGGRRVLGVSKWKKQDTLENTWKTIREGRLKKSETWERHNPPPAFKTMTKAETFKERSEPSLSQDELNRRVEAFITKFN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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