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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002955`

染色体: Chr05 坐标: 35705690-35708467 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002955`
名称	SmilChr05G002955
描述	uncharacterized SmilChr05G002955
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	35705690 - 35708467 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987016`
GeneID	`130987016`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987016`
原始查询	`SmilChr05G002955`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ribosomal protein L11 methyltransferase-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835475]; symbol=AT5G53920; hit=AT5G53920; species=arabidopsis; confidence=high
产物	ribosomal protein L11 methyltransferase-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835475]; symbol=AT5G53920; hit=AT5G53920; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G53920` (AT5G53920) ribosomal protein L11 methyltransferase-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835475] identity=57.6; qcov=0.813; evalue=5.98e-114; confidence=high
Rice	`Os05g0497675` - identity=52.7; qcov=0.806; evalue=1.65e-105; confidence=high
GO	GO:0005739 (mitochondrion); GO:0016279 (protein-lysine N-methyltransferase activity); GO:0018023 (peptidyl-lysine trimethylation)
KEGG	-
Pfam	PF05175 (MTS); PF06325 (PrmA); PF13489 (Methyltransf_23); PF13847 (Methyltransf_31)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987016

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057766558.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.60000	`XP_057766558.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057766558.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766558.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766558.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:35705883`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr5:35706023`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B132,B17,C32,C68
`Chr5:35706061`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr5:35706127`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr5:35706262`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:35706530`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B132,B17,C32,C68
`Chr5:35707358`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B15
`Chr5:35707358`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B15
`Chr5:35708200`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr5:35708266`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr5:35708271`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A9,B103,C12,C57,C71
`Chr5:35708311`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B110

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766558.1

386 aa

193

386

PrmA

MTS

Methyltransf_23

Methyltransf_31

PF06325 PrmA 84-384 aa PF05175 MTS 221-278 aa PF13489 Methyltransf_23 221-348 aa PF13847 Methyltransf_31 229-325 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766558.1`	Pfam	`PF06325`	PrmA	Family	84	384	3.4e-74	250.7	Ribosomal protein L11 methyltransferase (PrmA)
`XP_057766558.1`	Pfam	`PF05175`	MTS	Domain	221	278	8.1e-06	26.2	Methyltransferase small domain
`XP_057766558.1`	Pfam	`PF13489`	Methyltransf_23	Domain	221	348	6.1e-07	30.0	Methyltransferase domain
`XP_057766558.1`	Pfam	`PF13847`	Methyltransf_31	Domain	229	325	2e-07	31.6	Methyltransferase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910575.1
ATACATACAAATACCTGTTCTTGTATCTTTCTTTCATTTCTCTCACTCCTGTAACCTTGTCTCTCCAAGAGATACAAAAGAACCGTCCATGTCACTTTCACTCTCTTCTCTACGCAGTCATTTCTTCAAACACTTTAAGTTCTACAGTCGCGCCTCCAGTTTCTCTTCCTTGCACCGCCGCATTCACCGCCATCCTCCTCCCAGCCGCTTACCGCTCTTTCCCCCAATCGGAGCAGGTCAGCTGCAGCAACAACGGTCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987016
ATGTCACTTTCACTCTCTTCTCTACGCAGTCATTTCTTCAAACACTTTAAGTTCTACAGTCGCGCCTCCAGTTTCTCTTCCTTGCACCGCCGCATTCACCGCCATCCTCCTCCCAGCCGCTTACCGCTCTTTCCCCCAATCGGAGCAGGTCAGCTGCAGCAACAACGGTCGAGCCTCTTGACCGCCGCCGCCAATTATTCCACACTTCCATTCAATAATGGCGCTAACCACAATTCATACACTTCGCCTTACCTTTCTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766558.1
MSLSLSSLRSHFFKHFKFYSRASSFSSLHRRIHRHPPPSRLPLFPPIGAGQLQQQRSSLLTAAANYSTLPFNNGANHNSYTSPYLSVQICCPKHISDALSESLMCFGANSTTIDEQNFCGSDVEIWICSTFDVDQDVNECISRAANSVGLEETPKYKVEKKDHMDWIKLTQESFHPMEITEGLWIVPEWRNPPDLQATNIILNPGLAFGTGEHPTTKLCLLLLHRLIKGGEYFLDYGTGSGVLAIAALKFGAHLSVGFDI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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