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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002959`

染色体: Chr05 坐标: 35786267-35787433 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002959`
名称	SmilChr05G002959
描述	uncharacterized SmilChr05G002959
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	35786267 - 35787433 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025855`
GeneID	`131025855`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025855`
原始查询	`SmilChr05G002959`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0292200; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os12g0292200; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`AT2G06105` (AT2G06105) aspartyl protease gag-polyprotein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28717693] identity=42.6; qcov=0.19; evalue=1.42e-08; confidence=weak
Rice	`Os12g0292200` - identity=39.5; qcov=0.227; evalue=3.71e-13; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025855

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057811624.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057811624.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057811624.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811624.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811624.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:35786296`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B68
`Chr5:35786296`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B68
`Chr5:35786298`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	22	A1,A24,A5,B106,B112,B12,B122,B14,B16,B27,B34,B53,B72,B73,B78,C16,C21,C24,C36,C37,C42,C65
`Chr5:35786302`	`A`	`AT`	1bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	21	A1,A5,B106,B112,B12,B122,B14,B16,B27,B34,B53,B68,B73,B78,C16,C21,C24,C36,C37,C42,C65
`Chr5:35786323`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A23,B22,B49,B65,C6
`Chr5:35786364`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B12,C37
`Chr5:35786366`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C68
`Chr5:35786383`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,C37
`Chr5:35786531`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr5:35786558`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,B103,C12,C57
`Chr5:35786566`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B110,B23
`Chr5:35786570`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B127,D1,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955641.1
ATGGCCAATGCTATCAACAATCTGCATCAGTCAGGAAAATTCTCAAGCAACATTGCGGTGAGTAGTAGGGCTGCATCTGAAGGCAGCCATGGATTTGGTGAAATGGGGAATGAGCTGAAGAAAAATCATGAGGATAGTCTCAAGATGCCTATGGAGGAGATTTCGCCACCAGCTTTTGATCAGGAAATAGTTAAAGTCGTTGTCGAGGCTGTTGAAAAGAAGGACGATGATGGAACGAAGGTGATTTCACATGCAGCTGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025855
ATGGCCAATGCTATCAACAATCTGCATCAGTCAGGAAAATTCTCAAGCAACATTGCGGTGAGTAGTAGGGCTGCATCTGAAGGCAGCCATGGATTTGGTGAAATGGGGAATGAGCTGAAGAAAAATCATGAGGATAGTCTCAAGATGCCTATGGAGGAGATTTCGCCACCAGCTTTTGATCAGGAAATAGTTAAAGTCGTTGTCGAGGCTGTTGAAAAGAAGGACGATGATGGAACGAAGGTGATTTCACATGCAGCTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811624.1
MANAINNLHQSGKFSSNIAVSSRAASEGSHGFGEMGNELKKNHEDSLKMPMEEISPPAFDQEIVKVVVEAVEKKDDDGTKVISHAAVPTSFLQRHKKEGKGKFSKFLEIFKKVHINLPLVEALLEMPQYAKYLRDVVSRKKKLGEFETINLNEECSAILQRKLLVKIKDPGSFTIACMIGDQHFGKALCDLGTSINLMPLSIFKKLAIGELKPTSMVLQMADRSVTYPRGIEVGDFIFPADFVVLDIEDDKNIPLILGCP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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