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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002961`

染色体: Chr05 坐标: 35801738-35803498 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002961`
名称	SmilChr05G002961
描述	uncharacterized SmilChr05G002961
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	35801738 - 35803498 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025857`
GeneID	`131025857`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025857`
原始查询	`SmilChr05G002961`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629]; symbol=AT2G01050; hit=AT2G01050; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629]; symbol=AT2G01050; hit=AT2G01050; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT2G01050` (AT2G01050) zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629] identity=34.1; qcov=0.29; evalue=1.15e-27; confidence=weak
Rice	`Os12g0156200` - identity=22.4; qcov=0.312; evalue=1.74e-07; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14392 (zf-CCHC_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025857

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057811626.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057811626.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057811626.1`
4	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057811626.1`
5	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.20000	`XP_057811626.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:35801753`	`ACT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	184	A1,A10,A11,A13,A14,A15,A18,A19,A20,A21,A22,A23,A3,A4,A5,A6,A7,A8,B10,B103,B104,B108,B109,B110,B112,B113,B115,B117,B118,B119,B12,B120,B121,B122,B125,B127,B128,B13,B130,B131,B132,B135,B137,B139,B140,B15,B16,B17,B18,B19,B20,B21,B23,B24,B25,B26,B27,B29,B3,B30,B31,B32,B33,B34,B37,B38,B39,B40,B41,B44,B45,B46,B47,B48,B49,B5,B50,B52,B53,B54,B57,B58,B59,B6,B60,B61,B62,B63,B64,B65,B66,B67,B69,B70,B71,B72,B73,B74,B75,B76,B78,B79,B8,B83,B86,B87,B88,B89,B9,B90,B91,B92,B94,B97,B98,B99,C1,C10,C12,C14,C15,C16,C17,C18,C19,C2,C22,C23,C27,C28,C31,C32,C34,C35,C36,C37,C38,C41,C42,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C49,C51,C53,C54,C55,C56,C57,C58,C59,C6,C63,C64,C65,C66,C67,C68,C7,C70,C73,C74,C75,C76,C79,C80,C81,C82,C83,C84,C86,C87,C9,D1,D10,D11,D2,D4,D5,D6,D9
`Chr5:35801756`	`ACG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	145	A1,A10,A11,A14,A15,A19,A21,A24,A3,A5,A7,A8,B1,B101,B102,B103,B105,B106,B108,B109,B111,B112,B117,B118,B12,B123,B125,B127,B131,B132,B133,B137,B138,B139,B14,B140,B17,B18,B2,B21,B24,B25,B26,B28,B32,B34,B35,B36,B39,B4,B40,B41,B42,B48,B50,B52,B53,B55,B56,B57,B58,B60,B61,B62,B65,B66,B70,B71,B72,B73,B74,B76,B77,B78,B79,B8,B81,B82,B88,B9,B91,B95,B96,B97,B98,B99,C1,C10,C12,C14,C15,C17,C20,C21,C22,C23,C27,C28,C30,C32,C33,C34,C35,C37,C38,C39,C4,C41,C42,C43,C49,C5,C51,C53,C57,C58,C6,C61,C62,C63,C64,C66,C67,C68,C70,C71,C72,C73,C74,C75,C76,C78,C79,C82,C85,C86,C87,C9,D1,D10,D4,D5,D6,D7,D9
`Chr5:35801757`	`C`	`CGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B70
`Chr5:35801757`	`C`	`CGT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B70
`Chr5:35801759`	`C`	`CGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	30	A25,B100,B11,B120,B122,B128,B129,B22,B30,B33,B37,B38,B68,B84,B87,B90,B93,C11,C19,C24,C25,C31,C50,C56,C60,C64,C69,C79,D11,D3
`Chr5:35801774`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A14,B12,B78,C27,C37
`Chr5:35801823`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr5:35801836`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B18
`Chr5:35801844`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B57,B88,C27
`Chr5:35801846`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A22
`Chr5:35801846`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A22
`Chr5:35801891`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	C32,C68,C71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811626.1

586 aa

293

586

zf-CCHC_4

PF14392 zf-CCHC_4 270-301 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811626.1`	Pfam	`PF14392`	zf-CCHC_4	Domain	270	301	8.2e-07	29.3	Zinc knuckle

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955643.1
ATGACGACGTCTCCGACTACGCTGGTTCGTAACAATCTTAACCTGCCGGTGGTCTCCTCTAACTTCGACCATCGTCCGTCGATGGCGCACAAGGAAAAGCACGTTGCTGACTTTTCAAGCAAGAAACCGAGTGGGGCTGCTGGGACCTCACGACAGGGAGAACTCTTGGGATTGTCTCAAGAGCAACGTCCTTCATACGCTAGGGTGACTGGCCCTAATACCAAACGACGCCCGGATATATCAGCGCATAAGTTTCAAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025857
ATGACGACGTCTCCGACTACGCTGGTTCGTAACAATCTTAACCTGCCGGTGGTCTCCTCTAACTTCGACCATCGTCCGTCGATGGCGCACAAGGAAAAGCACGTTGCTGACTTTTCAAGCAAGAAACCGAGTGGGGCTGCTGGGACCTCACGACAGGGAGAACTCTTGGGATTGTCTCAAGAGCAACGTCCTTCATACGCTAGGGTGACTGGCCCTAATACCAAACGACGCCCGGATATATCAGCGCATAAGTTTCAAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811626.1
MTTSPTTLVRNNLNLPVVSSNFDHRPSMAHKEKHVADFSSKKPSGAAGTSRQGELLGLSQEQRPSYARVTGPNTKRRPDISAHKFQALRPIRHGEHGKLVVPRELQEYQLNKFKYALIGRLILNKGDKPRQSRDLKAELQSLWKISSPWQLMSMGKGFFTIKFQSQEDKAVAKAHMLWELSVGSLRLREWVRYFDPYKESSSLAQVWVRIYYLPVEFWHPEVISGIGHWLGQPLKIDSTSMTDDVAHFVRILVEIDLAQP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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