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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002965`

染色体: Chr05 坐标: 35944402-35946726 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002965`
名称	SmilChr05G002965
描述	protein TIC 22-like, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	35944402 - 35946726 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987021`
GeneID	`130987021`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987021`
原始查询	`SmilChr05G002965`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein TIC 22-like, chloroplastic
产物	protein TIC 22-like%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT3G23710` (Tic22-III) Tic22-like family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821952] identity=63.1; qcov=0.833; evalue=9.04e-21; confidence=medium
Rice	`Os07g0290800` (P0656C04.101) - identity=44.6; qcov=0.833; evalue=1.8e-11; confidence=low
GO	GO:0009507 (chloroplast); GO:0015031 (protein transport)
KEGG	-
Pfam	PF04278 (Tic22)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987021

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057766564.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057766564.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057766564.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057766564.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766564.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:35945116`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr5:35945123`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,B137
`Chr5:35945158`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A9
`Chr5:35945582`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,B137

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766564.1

78 aa

Tic22

PF04278 Tic22 1-65 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766564.1`	Pfam	`PF04278`	Tic22	Family	1	65	1.6e-16	61.1	Tic22-like family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009089538.1
CCTAGATACACAAAAAAACATGAAGTGAGTGAACACAAAATTGAAAAGCGGCGCCCCTATCCCCTCCACCCAGCTCTGCCGCCGCACAACCCTAGCCTCCCTCACTCGGCGACCACCTCCCTCCACTCCGGCGCGGTCGCGCGGCACCTCCTCGCTCCTCCCTCCACCCTGGCGCGACGCCTCCCTGCCAGAGACGACAACCTCCGTAGTCCCTCCACCCCTGCGCCCATCCGCCTCCGTCCACCCCGGCGCGGCACTGC...

XM_057910581.1
CCTAGATACACAAAAAAACATGAAGTGAGTGAACACAAAATTGAAAAGCGGCGCCCCTATCCCCTCCACCCAGCTCTGCCGCCGCACAACCCTAGCCTCCCTCACTCGGCGACCACCTCCCTCCACTCCGGCGCGGTCGCGCGGCACCTCCTCGCTCCTCCCTCCACCCTGGCGCGACGCCTCCCTGCCAGAGACGACAACCTCCGTAGTCCCTCCACCCCTGCGCCCATCCGCCTCCGTCCACCCCGGCGCGGCACTGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987021
ATGAAGTCTGTTGATTCTTCTATGAGTTCTGGCTCACAAGTTGTTCCAGTTGCTCTAAGCAAGGTTTTTGATCTTAAAGTTAATGGGGTGGCTTTGAGATTGTTACCCGAGGCTTCCCAGATAAAGAACGCATTGCAGGAGAGGAAAAGGGTTGGCATGGAAGACGAGAGCTTCTGTGGGGTCCTAGTTTTCCCGGTTCACTTTACTTGCCCACAACTTCAATCTTGTAACTCCTGA

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766564.1
MKSVDSSMSSGSQVVPVALSKVFDLKVNGVALRLLPEASQIKNALQERKRVGMEDESFCGVLVFPVHFTCPQLQSCNS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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