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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002966`

染色体: Chr05 坐标: 35954385-35958750 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002966`
名称	SmilChr05G002966
描述	PAP-specific phosphatase HAL2-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	35954385 - 35958750 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987023`
GeneID	`130987023`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987023`
原始查询	`SmilChr05G002966`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	PAP-specific phosphatase HAL2-like
产物	PAP-specific phosphatase HAL2-like
Arabidopsis	`AT5G54390` (HL) HAL2-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835527] identity=62.8; qcov=1.01; evalue=6.81e-140; confidence=high
Rice	`Os02g0805500` - identity=62.1; qcov=0.99; evalue=6.63e-137; confidence=high
GO	GO:0000103 (sulfate assimilation); GO:0008441 (3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase activity); GO:0046854 (phosphatidylinositol phosphate biosynthetic process)
KEGG	smil00920 (Sulfur metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00459 (Inositol_P)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987023

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057766565.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057766565.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057766565.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766565.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766565.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:35956733`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B69,B9
`Chr5:35956795`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr5:35956812`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr5:35957116`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B135
`Chr5:35957250`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C36

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766565.1

375 aa

188

375

Inositol_P

PF00459 Inositol_P 47-369 aa

XP_057766566.1

314 aa

157

314

Inositol_P

PF00459 Inositol_P 25-308 aa

XP_057766567.1

314 aa

157

314

Inositol_P

PF00459 Inositol_P 25-308 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766565.1`	Pfam	`PF00459`	Inositol_P	Family	47	369	1.4e-40	140.3	Inositol monophosphatase family
`XP_057766566.1`	Pfam	`PF00459`	Inositol_P	Family	25	308	7.1e-39	134.6	Inositol monophosphatase family
`XP_057766567.1`	Pfam	`PF00459`	Inositol_P	Family	25	308	7.1e-39	134.6	Inositol monophosphatase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910582.1
CCAGTTATTTATTATGACTCATTGGCACATATCATATCACACTACAATTTGATGCACGAAAGTGAGTATCACATTTAACCTCTTTTTAAAAATCTTGATTTTGATCCAAACCTATTTTTCATACGAAATGGAGAATCGCGAATTCTCAAAAGAGTTAAATGTGGCGGTGAGGGTGGTTCACATGGCTTGCTCGCTGTGCGAGAAGGTGCAAAAGCAGTTGATTTTGACGAACTCCGATCAGGTTAAATCCAAGGATGATG...

XM_057910583.1
AAAAGAGTTAAATGTGGCGGTGAGGGTGGTTCACATGGCTTGCTCGCTGTGCGAGAAGGTGCAAAAGCAGTTGATTTTGACGAACTCCGATCAGGTTAAATCCAAGGATGATGATTCCCTTGTTACTGTTGCAGAAACTTCGAACAATATATACATTATATATTGTGGGTTCGCGCCGTGATTATTTGGCCAATTAACAATTCCTCTGATAAATGGACGCATGGAGGGAATAAAAAAAGAAGAAGAAAAACCCATGTTTC...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130987023
ATGGAGAATCGCGAATTCTCAAAAGAGTTAAATGTGGCGGTGAGGGTGGTTCACATGGCTTGCTCGCTGTGCGAGAAGGTGCAAAAGCAGTTGATTTTGACGAACTCCGATCAGGTTAAATCCAAGGATGATGATTCCCTTGTTACTGTTGCAGACTGGAGCGTGCAAGCGACAGTAAGCTGGATGCTCTCCAAAGCTCTGGGTAGCCACATTTCCATTGTTGCTGAAGAAGATACTAAAAGTTTATCCAGGCCTGAGTC...

LOC130987023
ATGCTCTCCAAAGCTCTGGGTAGCCACATTTCCATTGTTGCTGAAGAAGATACTAAAAGTTTATCCAGGCCTGAGTCATCATCTCTGTTGGGAAGGGTTGTCGATGTGGTAAATGAATGTTTGGCTGACGCAACTAGGTTTGGTCTTCAAGGTCCTGACAATGCACTTAGTGCTTCTCAAGTTCTAGATGCAATCAGTCGGTGTAGCTCCCTTGGAGGGCGTGCAGGCCAACATTGGGTCCTTGATCCAGTTGACGGGAC...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057766565.1
MENREFSKELNVAVRVVHMACSLCEKVQKQLILTNSDQVKSKDDDSLVTVADWSVQATVSWMLSKALGSHISIVAEEDTKSLSRPESSSLLGRVVDVVNECLADATRFGLQGPDNALSASQVLDAISRCSSLGGRAGQHWVLDPVDGTLGFVRGDQYAVALAMIDGGDVIIGVLGCPNYPMKDNGLKKYIQQNLILSNKPSGEVGCVMYTMKGSRKAWMQPLIHHDEMLEWPNSAKPIQVSSISNPALATFCEPVEKANS...

XP_057766566.1
MLSKALGSHISIVAEEDTKSLSRPESSSLLGRVVDVVNECLADATRFGLQGPDNALSASQVLDAISRCSSLGGRAGQHWVLDPVDGTLGFVRGDQYAVALAMIDGGDVIIGVLGCPNYPMKDNGLKKYIQQNLILSNKPSGEVGCVMYTMKGSRKAWMQPLIHHDEMLEWPNSAKPIQVSSISNPALATFCEPVEKANSDHSFAAGIACNVGLRKKPLRVYSMVKYAAIARGEAEIYMRFARSAYKEKIWDHAAGVLLVQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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