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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002972`

染色体: Chr05 坐标: 36156816-36160134 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002972`
名称	SmilChr05G002972
描述	uncharacterized SmilChr05G002972
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	36156816 - 36160134 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025858`
GeneID	`131025858`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025858`
原始查询	`SmilChr05G002972`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OsABCF1; symbol=OsABCF1; hit=Os02g0826500; species=rice; confidence=low
产物	OsABCF1; symbol=OsABCF1; hit=Os02g0826500; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G64550` (ABCF3) ral control non-repressible 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842763] identity=82.5; qcov=0.42; evalue=4.33e-73; confidence=low
Rice	`Os02g0826500` (OsABCF1) - identity=87.7; qcov=0.374; evalue=6.94e-75; confidence=low
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity)
KEGG	-
Pfam	PF00005 (ABC_tran); PF05004 (IFRD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025858

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057811628.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.60000	`XP_057811628.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811628.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811628.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811628.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:36156827`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B111,C49,C68
`Chr5:36157378`	`A`	`ACC`	2bp_insertion	frameshift_variant	19	A18,A9,B106,B119,B129,B133,B14,B17,B24,B26,B66,B67,B74,B84,C23,C49,C6,C82,D5
`Chr5:36157381`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	60	A10,A15,A18,A19,A22,A3,A9,B10,B102,B103,B107,B111,B112,B113,B115,B120,B13,B138,B15,B22,B23,B26,B38,B39,B46,B56,B58,B6,B69,B71,B79,B90,B93,B96,B99,C1,C2,C23,C24,C3,C31,C32,C33,C38,C40,C41,C43,C45,C47,C52,C55,C57,C6,C64,C68,C78,C79,C80,C82,D11
`Chr5:36157411`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B50,B65
`Chr5:36157460`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B127,B77,C59
`Chr5:36157492`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,C35
`Chr5:36157497`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B33,B36,C85
`Chr5:36157510`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A9,C12,C57
`Chr5:36157528`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A9,C12,C57
`Chr5:36157530`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B124,B22,C29,C85,D3
`Chr5:36157535`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30
`Chr5:36157543`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811628.1

326 aa

163

326

ABC_tran

IFRD

PF00005 ABC_tran 88-206 aa PF05004 IFRD 238-273 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811628.1`	Pfam	`PF00005`	ABC_tran	Domain	88	206	6.2e-20	72.9	ABC transporter
`XP_057811628.1`	Pfam	`PF05004`	IFRD	Repeat	238	273	4.7e-06	26.5	Interferon-related developmental regulator (IFRD)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955645.1
ATGAGAGTCTTGAGCATACTGCCAAACCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCCACCGTTCTCTCCTCTTCCACCGCCTTACTCCCTTCAAACCGGGCATCACTGTCGCCGCCAGCCCCCATCCTCGCCGCCATTCGCCGCCGTGTAGCTGTTCGCGCCGCCGTCCTCGCCGCTGAGGCCCCCTATCCCTTTCTCTTCCGCGAACAGCAGCGGTCTGAGGCGCCGCCGCTGATGTATCCTTCTCTGAAACTCCGGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025858
ATGAGAGTCTTGAGCATACTGCCAAACCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCCACCGTTCTCTCCTCTTCCACCGCCTTACTCCCTTCAAACCGGGCATCACTGTCGCCGCCAGCCCCCATCCTCGCCGCCATTCGCCGCCGTGTAGCTGTTCGCGCCGCCGTCCTCGCCGCTGAGGCCCCCTATCCCTTTCTCTTCCGCGAACAGCAGCGGTCTGAGGCGCCGCCGCTGATGTATCCTTCTCTGAAACTCCGGCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811628.1
MRVLSILPNPLSLSLSLSPTVLSSSTALLPSNRASLSPPAPILAAIRRRVAVRAAVLAAEAPYPFLFREQQRSEAPPLMYPSLKLRRCCLVGPNGIGKSTILKLISGELQPSSGTVFRSAKVRIAVFNQHHVDGLDLFSNPLLYMMRCFPGVPEQKLRGHLGSLGITGNLALQPMYTLSGGQKSRVAFVKITFKKPHILLLDEPSNHLVCYIAAAVSHSCYPSWMPNLIMDIAMMCSQLLQCLAVIAFVGGEDPEQTEKS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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