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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002973`

染色体: Chr05 坐标: 36178786-36183702 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002973`
名称	SmilChr05G002973
描述	tRNA (guanine(37)-N1)-methyltransferase 1-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	36178786 - 36183702 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987028`
GeneID	`130987028`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987028`
原始查询	`SmilChr05G002973`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	tRNA (guanine(37)-N1)-methyltransferase 1-like
产物	tRNA (guanine(37)-N1)-methyltransferase 1-like
Arabidopsis	`AT4G27340` (AT4G27340) Met-10+ like family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828842] identity=61; qcov=1.05; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0390400` (OJ1123_G09.29-2) - identity=57.4; qcov=0.952; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0002939 (tRNA N1-guanine methylation); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0009019 (GO:0009019)
KEGG	-
Pfam	PF02475 (TRM5-TYW2_MTfase); PF25133 (TYW2_N_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987028

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057766570.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.60000	`XP_057766570.1`
3	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057766570.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057766570.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766570.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:36178867`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr5:36178911`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30
`Chr5:36179164`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B33,C29,C7
`Chr5:36179332`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B102,B89,D4
`Chr5:36179419`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B101,B104,B36,B8,C72
`Chr5:36179450`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B22,B36,D5
`Chr5:36179522`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72
`Chr5:36183535`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C4
`Chr5:36183553`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766570.1

584 aa

292

584

TYW2_N_2

TRM5-TYW2_MTfase

PF25133 TYW2_N_2 297-375 aa PF02475 TRM5-TYW2_MTfase 379-505 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766570.1`	Pfam	`PF25133`	TYW2_N_2	Domain	297	375	1.1e-20	74.3	TYW2 N-terminal domain
`XP_057766570.1`	Pfam	`PF02475`	TRM5-TYW2_MTfase	Domain	379	505	1.2e-29	104.1	TRM5/TYW2 methyltransferase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910587.1
AAAAAAAAAAAAAAAATACTAACGCAAGCAGCATCTAAGAATGAGTTAGTTCCTCCAAGTAGCCGTGGCCGAAATAATGGCGACTAAGTTTTCCCTCTTCCGACCTCGTCCTCTACCACCGATCACACTCTTTCCCGCTGCCAAACCCCGATTCGTCGCAGCCCTCTCTTGCGGCGGCAACGCTGTTACCTCCTTTTCATACGGCCCCTCCCTCCAGAAAGGCCACTCGCCTCTTCCTCTTGAATTACGAAGGTGCCCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987028
ATGGCGACTAAGTTTTCCCTCTTCCGACCTCGTCCTCTACCACCGATCACACTCTTTCCCGCTGCCAAACCCCGATTCGTCGCAGCCCTCTCTTGCGGCGGCAACGCTGTTACCTCCTTTTCATACGGCCCCTCCCTCCAGAAAGGCCACTCGCCTCTTCCTCTTGAATTACGAAGGTGCCCCTCCTTCGCCGGCGAGAACGTCGCTTCCCTTGACGAAGCTACCTTCACTCGAGTCTTCGACATTTCTGCACTCCGTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766570.1
MATKFSLFRPRPLPPITLFPAAKPRFVAALSCGGNAVTSFSYGPSLQKGHSPLPLELRRCPSFAGENVASLDEATFTRVFDISALRVPSAICSALENRLRGHLLNWPRIRNITRVPGDEIDEEIKTLLPQSASGAEAEGEALVALNRRIYGKAEWDGEPLNAVLYRDKLARTFNSQGYASFRNLARISRPKKGKTRDDGEKRAMKGVRRSEGALVEVVEFHDSEDLSGLLGEDAPQQQKWLGPTRLLLLDERYSNKSIEE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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