Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；未闭环名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002983`

染色体: Chr05 坐标: 36383001-36384902 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002983`
名称	SmilChr05G002983
描述	uncharacterized SmilChr05G002983
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	36383001 - 36384902 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987035`
GeneID	`130987035`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987035`
原始查询	`SmilChr05G002983`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987035

打开注释模块

非零投票定位候选（最多五项）

Rank	定位位置	中文	五折投票比例	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057766583.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:36383198`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A3,B102
`Chr5:36383231`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C74
`Chr5:36383231`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C74
`Chr5:36383234`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B22,C48,D4
`Chr5:36383268`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B111
`Chr5:36383274`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B23,B44,C80
`Chr5:36383278`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B64,C45,C54
`Chr5:36383278`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B64,C45,C54
`Chr5:36383309`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C18,D9
`Chr5:36383445`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr5:36383460`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45
`Chr5:36383476`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,B42,B43

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009089543.1
ATCACTCCCGCTCAATTTTCACGCTAACACCTCAAAAAGAAAGAAAAACATTGAATCATAGTTTCAGGCTTACTGCGCTAGCCGCCTTCAACTTTCTTCTCCAACGTTCAGATCGACGAAAAGCCTCTTCTGCGCCGCCTCCATCTCTTTTCCCCCGCCATCTCACTTGCCGACGAACAAATTCTCGCCCGTATCTCATGATCTGTTGCCTTTGTCACGCTTGCCTCCAAATCTAAAACCCTAGGTAGTCGCCGCCGCCG...

XM_057910600.1
CTTCATTCCTTCACGCTAACACCTAAAACCCCTATTCATCACTCCCGCTCAATTTTCACGCTAACACCTCAAAAAGAAAGAAAAACATTGAATCATAGTTTCAGGCTTACTGCGCTAGCCGCCTTCAACTTTCTTCTCCAACGTTCAGATCGACGAAAAGCCTCTTCTGCGCCGCCTCCATCTCTTTTCCCCCGCCATCTCACTTGCCGACGAACAAATTCTCGCCCGTATCTCATGATCTGTTGCCTTTGTCACGCTTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

lcl|NC_080391.1_cds_XP_057766583.1_28765
ATGAATCATGCATGCGGAACAAAATCTATTGCGCAGTTTTGCTACGAAGAGCGTGACAATGAAACTGGAGAGGAGCCTAGTCGCACAACTACATGGAGATTGAGCCGTTATAGTAACACGAAAAAGAACTGGATCGATGAGGCCTCAAAGGAAGTTTATGTAATTGCAAGCTTTTGTCAAGAAGATGAAGCTTTTGTCAAGGTTCTTGGTGAGGAAAAATCGAGCGGACTTCGAGGATGTGGAGATGGATTGAAGCCACC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766583.1
MNHACGTKSIAQFCYEERDNETGEEPSRTTTWRLSRYSNTKKNWIDEASKEVYVIASFCQEDEAFVKVLGEEKSSGLRGCGDGLKPPSKRGERINLDLQKENEELKKKNEELASRFESLEA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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