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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003039`

染色体: Chr05 坐标: 38140683-38141114 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003039`
名称	SmilChr05G003039
描述	uncharacterized SmilChr05G003039
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	38140683 - 38141114 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025886`
GeneID	`131025886`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025886`
原始查询	`SmilChr05G003039`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861]; symbol=AT2G13770; hit=AT2G13770; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861]; symbol=AT2G13770; hit=AT2G13770; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=47.5; qcov=0.972; evalue=8.11e-35; confidence=medium
Rice	`Os06g0597250` - identity=44.8; qcov=1; evalue=2.08e-32; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025886

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057811649.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811649.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811649.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057811649.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057811649.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:38140732`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C24,C3
`Chr5:38140748`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,B24,C11
`Chr5:38140749`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B31,B40
`Chr5:38140757`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr5:38140766`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B130,B136,C33
`Chr5:38140766`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B130,B136,C33
`Chr5:38140802`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B112,B130,B39,C33
`Chr5:38140830`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	39	A19,A4,A7,A8,B111,B112,B113,B119,B137,B138,B17,B29,B35,B36,B39,B46,B5,B57,B60,B71,B78,B87,B88,B89,B96,C3,C32,C38,C42,C43,C47,C53,C54,C67,C7,C79,C86,D3,D5
`Chr5:38140833`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr5:38140868`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:38140999`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B132,B17,D5
`Chr5:38141073`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B119

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811649.1

143 aa

143

Plant_tran

PF04827 Plant_tran 4-103 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811649.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	4	103	8.1e-40	137.3	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955666.1
ATGGGGGTGCCGATCACATATCAAGTCAACAACTCCTACTACAGAAGTGGGTACTACTTGACTGACGGCATCTACCCCAATTGGCCTATTATCGTGAAGAGTCCTACACATCCAACGGACGCGAAGGGGAAGAGGTTCAAAGTGATGCAGGAAGCAGCTCGCAAGGATATCGAACGAGCTTTCGGCGTGCTTCAAACTCGTTGGGCAATTGCCAAAGAACCATCACGTTTTTGGAGCAAGGAGAAGATGAGCGACATCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025886
ATGGGGGTGCCGATCACATATCAAGTCAACAACTCCTACTACAGAAGTGGGTACTACTTGACTGACGGCATCTACCCCAATTGGCCTATTATCGTGAAGAGTCCTACACATCCAACGGACGCGAAGGGGAAGAGGTTCAAAGTGATGCAGGAAGCAGCTCGCAAGGATATCGAACGAGCTTTCGGCGTGCTTCAAACTCGTTGGGCAATTGCCAAAGAACCATCACGTTTTTGGAGCAAGGAGAAGATGAGCGACATCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811649.1
MGVPITYQVNNSYYRSGYYLTDGIYPNWPIIVKSPTHPTDAKGKRFKVMQEAARKDIERAFGVLQTRWAIAKEPSRFWSKEKMSDIMFTCIILHNMIIEDEGEHTTQWEEEVADEASSSTATSCPRAGVPLNFRAFVARQTSM

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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