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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003043`

染色体: Chr05 坐标: 38218621-38223049 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003043`
名称	SmilChr05G003043
描述	uncharacterized SmilChr05G003043
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	38218621 - 38223049 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024330`
GeneID	`131024330`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024330`
原始查询	`SmilChr05G003043`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DTW domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835579]; symbol=AT5G54880; hit=AT5G54880; species=arabidopsis; confidence=high
产物	DTW domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835579]; symbol=AT5G54880; hit=AT5G54880; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G54880` (AT5G54880) DTW domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835579] identity=46.5; qcov=0.958; evalue=1.5e-95; confidence=high
Rice	`Os03g0568600` - identity=57.2; qcov=0.396; evalue=1.55e-50; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03942 (DTW)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024330

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057809826.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057809826.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809826.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809826.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057809826.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:38222013`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B39
`Chr5:38222172`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B33,B94,B99,C9
`Chr5:38222224`	`ACT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	D11
`Chr5:38222224`	`ACT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	D11
`Chr5:38222371`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:38222531`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B121
`Chr5:38222582`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,B101,B104,B13
`Chr5:38222746`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr5:38222892`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B4,C19
`Chr5:38222896`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	A25,B29,B44,B46,B6,B73,B97,C39
`Chr5:38222934`	`TAA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C64
`Chr5:38222934`	`TAA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C64

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809826.1

384 aa

192

384

DTW

PF03942 DTW 52-116 aa PF03942 DTW 246-370 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809826.1`	Pfam	`PF03942`	DTW	Domain	52	116	1.7e-37	129.8	DTW domain
`XP_057809826.1`	Pfam	`PF03942`	DTW	Domain	246	370	1.7e-37	129.8	DTW domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XR_009101764.1
CCAAAACCCAAAGGGACTCGCCCACTGCAGATGTTCTAAACGCAATGCCCGCCTTCTCCAAATTGCAACAGGGTATCTCGCAATTCTACTCTCCCTTTCTCAACCATATATCTTTAACCAACAAAATCGCCAAATCCCTTCAGTTTCACCCCCTAACCCTAATTTCGCTAATGGTGACTGCATCCGCTTCTACAAAGAGACCCACTTGTCCATCATGCTCTAAACCGGCCAGCATTTGCCTTTGCAGCCGCCTCCGAACT...

XR_009101765.1
CCAAAACCCAAAGGGACTCGCCCACTGCAGATGTTCTAAACGCAATGCCCGCCTTCTCCAAATTGCAACAGGGTATCTCGCAATTCTACTCTCCCTTTCTCAACCATATATCTTTAACCAACAAAATCGCCAAATCCCTTCAGTTTCACCCCCTAACCCTAATTTCGCTAATGGTGACTGCATCCGCTTCTACAAAGAGACCCACTTGTCCATCATGCTCTAAACCGGCCAGCATTTGCCTTTGCAGCCGCCTCCGAACT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024330
ATGCCCGCCTTCTCCAAATTGCAACAGGGTATCTCGCAATTCTACTCTCCCTTTCTCAACCATATATCTTTAACCAACAAAATCGCCAAATCCCTTCAGTTTCACCCCCTAACCCTAATTTCGCTAATGGTGACTGCATCCGCTTCTACAAAGAGACCCACTTGTCCATCATGCTCTAAACCGGCCAGCATTTGCCTTTGCAGCCGCCTCCGAACTCCGCTTCTCCATAATTCTGTCTCCGTCACCATTTTCCAACATAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809826.1
MPAFSKLQQGISQFYSPFLNHISLTNKIAKSLQFHPLTLISLMVTASASTKRPTCPSCSKPASICLCSRLRTPLLHNSVSVTIFQHSLEKNHPLNSARIAKIGLKNVNVVTVSDVNFEAQFFIRPLEVDESCHLFDEMPSKGRNDEFLETANLGADYADLEGRIMGRNEFNVAETSQLCQHVMNLKGSELSAFDFTIAKSGTISSMNCKMGPAKIQEMSFDQLLASDAAVDEIRKGFVVKKVKVSEAFGECEEVEEFEIA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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