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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003050`

染色体: Chr05 坐标: 38273221-38273979 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003050`
名称	SmilChr05G003050
描述	uncharacterized SmilChr05G003050
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	38273221 - 38273979 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025887`
GeneID	`131025887`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025887`
原始查询	`SmilChr05G003050`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843429]; symbol=AT1G70900; hit=AT1G70900; species=arabidopsis; confidence=high
产物	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843429]; symbol=AT1G70900; hit=AT1G70900; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G70900` (AT1G70900) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843429] identity=69.9; qcov=0.971; evalue=1.15e-65; confidence=high
Rice	`Os08g0433200` - identity=68.4; qcov=0.971; evalue=6.7e-64; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025887

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057811650.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	1.00000	`XP_057811650.1`
3	Mitochondrion outer membrane	线粒体外膜	0.20000	`XP_057811650.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811650.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811650.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:38273238`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B115,B122,B127,C34,C53
`Chr5:38273264`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	22	A19,A6,B109,B119,B120,B133,B134,B16,B53,B59,B74,B79,B90,B91,B92,B97,C12,C25,C45,C72,C82,C86
`Chr5:38273271`	`GTC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	44	A11,A18,A19,A20,A21,A25,B10,B102,B105,B113,B115,B119,B120,B123,B126,B129,B133,B137,B15,B27,B29,B33,B34,B4,B50,B56,B66,B74,B76,B79,C17,C18,C21,C3,C35,C38,C44,C46,C52,C53,C63,C7,C83,C9
`Chr5:38273274`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	44	A11,A18,A19,A20,A21,A25,B10,B102,B105,B113,B115,B119,B120,B123,B126,B129,B133,B137,B15,B27,B29,B33,B34,B4,B50,B56,B66,B74,B76,B79,C17,C18,C21,C3,C35,C38,C44,C46,C52,C53,C63,C7,C83,C9
`Chr5:38273367`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C2,C25
`Chr5:38273372`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B40
`Chr5:38273372`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr5:38273390`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B113,B137,B68,B80,C41
`Chr5:38273414`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr5:38273520`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B117,B13,B4,B63,C50
`Chr5:38273629`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B76,C34
`Chr5:38273765`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B106,B27,B45,B74,C36

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955667.1
ATGGTAATTATATATAGGAAAGTTTGGCATCAAAGACCTGCTTGTTTGAGGTCCATCCATTGCACTCATACTGGCGATCAGAACATTGCTGAAACCGTTGCTAATGTGCTTACTTCACTTCCTTTTATTGCCATCGGACTCCATGCCCCAAGGAAAAATGTGAATTGTAAAATATACGCAAATTCATTGATTGGAGTGGGAGTTGCTTCAAGTTTCTATCATGCTTCAAGAGGGAGATTGAGGAAGTATCTCAGATGGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025887
ATGGTAATTATATATAGGAAAGTTTGGCATCAAAGACCTGCTTGTTTGAGGTCCATCCATTGCACTCATACTGGCGATCAGAACATTGCTGAAACCGTTGCTAATGTGCTTACTTCACTTCCTTTTATTGCCATCGGACTCCATGCCCCAAGGAAAAATGTGAATTGTAAAATATACGCAAATTCATTGATTGGAGTGGGAGTTGCTTCAAGTTTCTATCATGCTTCAAGAGGGAGATTGAGGAAGTATCTCAGATGGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811650.1
MVIIYRKVWHQRPACLRSIHCTHTGDQNIAETVANVLTSLPFIAIGLHAPRKNVNCKIYANSLIGVGVASSFYHASRGRLRKYLRWADYTMIATTTCLSRALRKENPKLSASALFLPIQPLMVSAVHTGIMEEFSSL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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