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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003053`

染色体: Chr05 坐标: 38314372-38316112 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003053`
名称	SmilChr05G003053
描述	uncharacterized SmilChr05G003053
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	38314372 - 38316112 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025889`
GeneID	`131025889`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025889`
原始查询	`SmilChr05G003053`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0286500; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os04g0286500; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G66235` (AT1G66235) no-apical-meristem-associated carboxy-terminal domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842939] identity=22.8; qcov=0.547; evalue=3.43e-07; confidence=weak
Rice	`Os04g0286500` - identity=27.6; qcov=0.742; evalue=1.21e-13; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025889

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057811652.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811652.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811652.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057811652.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057811652.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:38314484`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B121,C4,C85
`Chr5:38314493`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,B139,C4
`Chr5:38314597`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B21
`Chr5:38314602`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B23,B44
`Chr5:38314661`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	48	A13,A18,B105,B11,B12,B120,B16,B20,B27,B3,B30,B34,B45,B47,B49,B50,B55,B62,B64,B68,B69,B78,B85,B93,B94,C10,C13,C2,C23,C27,C28,C45,C46,C48,C50,C51,C53,C56,C58,C62,C63,C65,C71,C74,C75,C81,C85,D1
`Chr5:38314670`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	48	A13,A18,B105,B11,B12,B120,B16,B20,B27,B3,B30,B34,B45,B47,B49,B50,B55,B62,B64,B68,B69,B78,B85,B93,B94,C10,C13,C2,C23,C27,C28,C45,C46,C48,C50,C51,C53,C56,C58,C62,C63,C65,C71,C74,C75,C81,C85,D1
`Chr5:38314717`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr5:38314719`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr5:38314728`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B82,B9,D2
`Chr5:38314741`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B6,B65,C39,C75
`Chr5:38314760`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B82,B9,D2
`Chr5:38314773`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B6,C75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955669.1
ATGTCGCAGACCAGCGTGTTGTCATCATCTGGTGATTGCGACAGAGCGGGCCTTGAAGGAATAAATTTGAACGCTCAATTTGCGGTGACGACCGACCCCAAGGTGGAGGAGATAGCCTCCATTCTGCCGTCTACCAAACAAAGAGGCGGCTACACCCCGGCGGAGACGACACTCGTGTGTCGTTTGTATGCGGAGGCCACATGCAACTCGATCAAAGGCGCTGACCAAAAAGGAGCATGCTATTGGGGCGATATCCTCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025889
ATGTCGCAGACCAGCGTGTTGTCATCATCTGGTGATTGCGACAGAGCGGGCCTTGAAGGAATAAATTTGAACGCTCAATTTGCGGTGACGACCGACCCCAAGGTGGAGGAGATAGCCTCCATTCTGCCGTCTACCAAACAAAGAGGCGGCTACACCCCGGCGGAGACGACACTCGTGTGTCGTTTGTATGCGGAGGCCACATGCAACTCGATCAAAGGCGCTGACCAAAAAGGAGCATGCTATTGGGGCGATATCCTCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811652.1
MSQTSVLSSSGDCDRAGLEGINLNAQFAVTTDPKVEEIASILPSTKQRGGYTPAETTLVCRLYAEATCNSIKGADQKGACYWGDILMKYNAQQPPGTIQRDVRQIKSHFQRVQKDVKLWEAIYDKCWENWGSGMSYEQITTQATQMYAFEHECIFKYPHAWHVLHECQKFVTIGEDVHSSKQLKVSDGRHTTTSSEPSIYTRPQCQKEAKKDKGKKKTESSDEQT

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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