当前解析结果
SmilChr05G003054| 统一新 Gene ID | SmilChr05G003054 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G003054 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G003054 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 38323314 - 38323796 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131025890 |
|---|---|
| GeneID | 131025890 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131025890 |
| 原始查询 | SmilChr05G003054 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hexon [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835575]; symbol=AT5G54850; hit=AT5G54850; species=arabidopsis; confidence=medium |
| 产物 | hexon [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835575]; symbol=AT5G54850; hit=AT5G54850; species=arabidopsis; confidence=medium |
| Arabidopsis | AT5G54850 (AT5G54850)hexon [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835575] identity=58.9; qcov=0.456; evalue=2.84e-24; confidence=medium |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131025890 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057811653.1 |
| 2 | Cytoskeleton | 细胞骨架 | 0.40000 | XP_057811653.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.40000 | XP_057811653.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057811653.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057811653.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:38323437 |
TC |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 4 | A9,B103,C12,C57 |
Chr5:38323437 |
TC |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 4 | A9,B103,C12,C57 |
Chr5:38323439 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A9,B103,C12,C57 |
Chr5:38323750 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A2,C60,C62,C82,D3 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。