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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003058`

染色体: Chr05 坐标: 38406650-38407552 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003058`
名称	SmilChr05G003058
描述	protein LHCP TRANSLOCATION DEFECT-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	38406650 - 38407552 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024340`
GeneID	`131024340`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024340`
原始查询	`SmilChr05G003058`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein LHCP TRANSLOCATION DEFECT-like
产物	protein LHCP TRANSLOCATION DEFECT-like
Arabidopsis	`AT1G50900` (GDC1) Ankyrin repeat family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841512] identity=79.2; qcov=0.743; evalue=1.05e-76; confidence=high
Rice	`Os07g0520800` - identity=72.7; qcov=0.754; evalue=1.91e-62; confidence=high
GO	GO:0006886 (intracellular protein transport); GO:0009570 (chloroplast stroma); GO:0009941 (chloroplast envelope); GO:0090391 (granum assembly)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024340

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057809833.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057809833.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809833.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809833.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809833.1`

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EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:38406950`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B52,C29,C7
`Chr5:38407410`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	A24,B137,B39,B60
`Chr5:38407410`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B137,B39,B60

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预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

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cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953850.1
TTCTAATTATCACCTATGGGCTATGGGCCCACCACTCTGATTTGTTGCTTTTAATTTCTTAGAAACTTATACATACTTTATTGTAAGATTTGATTTGTGATAATATTGATAACCGATAAGGTTTGGAGGATGTGAGTAAGTGAAAAATCTGGAAATCAAGAGCGTAAATGGCATCCGTATTTCCTTGTACTCTCCAACCAAAATTCTCCCTGAATAAGTCATGTTCTACTTCAGTTGCGATTACTCGGCGTGAGTTCGTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024340
ATGGCATCCGTATTTCCTTGTACTCTCCAACCAAAATTCTCCCTGAATAAGTCATGTTCTACTTCAGTTGCGATTACTCGGCGTGAGTTCGTGGGTGGTTCTGCGAGAAGCATTGGATGGTGCAGCAGAAGCAGCAGCAGATTGGGTCCCAGCTGTGGTTCCAGAAGCATTTGCTGGTTTAGGTTCGGCAAGAATGGCGTTGACGCCGAAGGCGCTGGCATCTACGGCAGCCAGGCTCGCGACGATTTCGACCGCGACGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809833.1
MASVFPCTLQPKFSLNKSCSTSVAITRREFVGGSARSIGWCSRSSSRLGPSCGSRSICWFRFGKNGVDAEGAGIYGSQARDDFDRDDVEQYFNYMGMLAVEGSYDKMEALLQQNIHPVDILLLMAASEADIPKIEELMRAGADYTVKDADGRTALDRAASDDVRDFILGFSVQKA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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