当前解析结果
SmilChr05G003072| 统一新 Gene ID | SmilChr05G003072 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G003072 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G003072 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 38651653 - 38653156 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131024351 |
|---|---|
| GeneID | 131024351 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131024351 |
| 原始查询 | SmilChr05G003072 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | Chaperone DnaJ-domain superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843439]; symbol=AT1G71000; hit=AT1G71000; species=arabidopsis; confidence=medium |
| 产物 | Chaperone DnaJ-domain superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843439]; symbol=AT1G71000; hit=AT1G71000; species=arabidopsis; confidence=medium |
| Arabidopsis | AT1G71000 (AT1G71000)Chaperone DnaJ-domain superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843439] identity=51.4; qcov=0.728; evalue=3.28e-41; confidence=medium |
| Rice | Os01g0606900 (OsDjC10)- identity=54; qcov=0.646; evalue=5.51e-37; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00226 (DnaJ) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131024351 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057809841.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 1.00000 | XP_057809841.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057809841.1 |
| 4 | Nucleoplasm | 核质 | 0.20000 | XP_057809841.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057809841.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:38652357 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B107,B31,C28 |
Chr5:38652726 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | B39 |
Chr5:38652726 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B39 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057809841.1PF00226
DnaJ 13-78 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057809841.1 |
Pfam | PF00226 |
DnaJ | Domain | 13 | 78 | 1.4e-24 | 86.7 | DnaJ domain |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。