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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003075`

染色体: Chr05 坐标: 38816599-38818618 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003075`
名称	SmilChr05G003075
描述	ylmG homolog protein 1-2, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	38816599 - 38818618 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025899`
GeneID	`131025899`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025899`
原始查询	`SmilChr05G003075`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ylmG homolog protein 1-2, chloroplastic-like
产物	ylmG homolog protein 1-2%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT4G27990` (YLMG1-2) YGGT family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828912] identity=68.3; qcov=0.609; evalue=1.08e-63; confidence=high
Rice	`Os07g0185300` - identity=48.9; qcov=0.395; evalue=7.98e-25; confidence=low
GO	GO:0010020 (chloroplast fission); GO:0016020 (membrane); GO:0090143 (GO:0090143)
KEGG	-
Pfam	PF02325 (CCB3_YggT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025899

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057811661.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.80000	`XP_057811661.1`
3	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.60000	`XP_057811661.1`
4	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.40000	`XP_057811661.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811661.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:38816682`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,B76
`Chr5:38816710`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B28
`Chr5:38816726`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,B122
`Chr5:38816750`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	B22,B58,B62,B79,C21,C48
`Chr5:38816790`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr5:38816815`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B101,B14,B26,C37,D10
`Chr5:38816816`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B132,C68
`Chr5:38816817`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B50,C42,D6
`Chr5:38816837`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B42,C21,C48
`Chr5:38816837`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B42,C21,C48
`Chr5:38816868`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B28
`Chr5:38816878`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C42,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811661.1

238 aa

119

238

CCB3_YggT

PF02325 CCB3_YggT 160-231 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811661.1`	Pfam	`PF02325`	CCB3_YggT	Domain	160	231	7.7e-16	58.8	CCB3/YggT

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955678.1
ATGAGGGTGGTGGAGGCGCGCAGGAGGATGGTGGAGGCGGTGGACGCACAGGAGAATGGTGGAGGCGGCGGAGGCGAGAGGTCCGAGGATGATGGAGGGCGCAGGAGGATGGTGGAGACGGTGGAGGAGGCGAGAGGCTTGAGGGTGGTGGAGGATGGTGGAGGCGGCACATATGAGAGAGAGAGAGAGAGAAGAAAGCAGCAGAGGGGAATCTCCGCCTCCATTTTTTCCCCCGCTATTTCCAAACCGGCTCCGGAAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025899
ATGAGGGTGGTGGAGGCGCGCAGGAGGATGGTGGAGGCGGTGGACGCACAGGAGAATGGTGGAGGCGGCGGAGGCGAGAGGTCCGAGGATGATGGAGGGCGCAGGAGGATGGTGGAGACGGTGGAGGAGGCGAGAGGCTTGAGGGTGGTGGAGGATGGTGGAGGCGGCACATATGAGAGAGAGAGAGAGAGAAGAAAGCAGCAGAGGGGAATCTCCGCCTCCATTTTTTCCCCCGCTATTTCCAAACCGGCTCCGGAAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811661.1
MRVVEARRRMVEAVDAQENGGGGGGERSEDDGGRRRMVETVEEARGLRVVEDGGGGTYERERERRKQQRGISASIFSPAISKPAPEILIGSTRTITTLVALGLTASKFFAHKLFNLAVQLKEPIEPLLCSVGPTFFAAAKEVPTVSLNTPFMMVAAGMAKWLDLYSGVLMVHVLLSWFPNIPWDRQPLSAIRDLCDPYLNLFRNIIPPIFDTLDVSPLLAFTVLGTLGSILNSSRQSY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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