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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003076`

染色体: Chr05 坐标: 38834739-38835900 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003076`
名称	SmilChr05G003076
描述	uncharacterized SmilChr05G003076
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	38834739 - 38835900 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024354`
GeneID	`131024354`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024354`
原始查询	`SmilChr05G003076`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hAT dimerization domain-containing protein / transposase-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816101]; symbol=AT2G16040; hit=AT2G16040; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	hAT dimerization domain-containing protein / transposase-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816101]; symbol=AT2G16040; hit=AT2G16040; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G16040` (AT2G16040) hAT dimerization domain-containing protein / transposase-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816101] identity=44.6; qcov=0.902; evalue=3.29e-71; confidence=medium
Rice	`-` -
GO	GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF05699 (Dimer_Tnp_hAT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024354

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057809843.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057809843.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809843.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057809843.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057809843.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:38834936`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr5:38834951`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr5:38834955`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	A10
`Chr5:38834955`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A10
`Chr5:38834964`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	A1,B137,B42,B67,C25,C43,C59
`Chr5:38834966`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,B139,C4,C85
`Chr5:38834988`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B112,B91,C44
`Chr5:38835003`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr5:38835021`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,B99
`Chr5:38835057`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	10	B112,B130,B46,B53,B66,B73,B91,C2,C33,C44
`Chr5:38835058`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B136,B67,B99,D3
`Chr5:38835073`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809843.1

276 aa

138

276

Dimer_Tnp_hAT

PF05699 Dimer_Tnp_hAT 163-252 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809843.1`	Pfam	`PF05699`	Dimer_Tnp_hAT	Domain	163	252	1.3e-16	60.8	hAT family C-terminal dimerisation region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953860.1
AGCTATTAGATTTCAATGTCCACAAATAAGATTCGCTTTGTTAAAATTATATGAATCTTGTGATAATGATGTAAAAACAAAGAGTGAAGCAGAAGTTTGGTTAATGCTTTAGAAAGTTTTGAGTTTTTGTTTGGCATGGTGGTTTGGTATGAAATTCTTTTTGCTGTTAATATGGTAAGCAAAAAGTTACAATCTAAGTCTATGTGCATCGATGCTACTATGAAGCAATTGGAAGGTGTATTATCATTTTTTGAAAAGTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024354
ATGGTGGTTTGGTATGAAATTCTTTTTGCTGTTAATATGGTAAGCAAAAAGTTACAATCTAAGTCTATGTGCATCGATGCTACTATGAAGCAATTGGAAGGTGTATTATCATTTTTTGAAAAGTATAGAGAAGAAGGTTTTATATCAAGTATGAATGTTGTTAAAAGTGTTGCACTTGAAATGGATGTAGAGCCTATTTTTCCAATTAAACGTCGTATGATTAGGAAAAAGTACTTTGGTGAGAATAATGAGGAAGAAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809843.1
MVVWYEILFAVNMVSKKLQSKSMCIDATMKQLEGVLSFFEKYREEGFISSMNVVKSVALEMDVEPIFPIKRRMIRKKYFGENNEEEEDNSPEELFRTRYFLVVVDMAIVYLKNRFEELKTFEGIFGFLYDSNKLKSLGEKELRDSCVNFHSTFSHENLSDIDLDDLYSELKVLQLTLPTNLLSAIEILTFVKSADCYPNVSIAYRILLTVPVTVASAERNFSKLKLIKTYLRSSMSQERLNGLTILAIEKDMLEHINIDV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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