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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003077`

染色体: Chr05 坐标: 38835915-38837390 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003077`
名称	SmilChr05G003077
描述	uncharacterized SmilChr05G003077
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	38835915 - 38837390 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024355`
GeneID	`131024355`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024355`
原始查询	`SmilChr05G003077`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	TTF-type zinc finger protein with HAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826611]; symbol=AT4G10200; hit=AT4G10200; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	TTF-type zinc finger protein with HAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826611]; symbol=AT4G10200; hit=AT4G10200; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT4G10200` (AT4G10200) TTF-type zinc finger protein with HAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826611] identity=40.5; qcov=0.815; evalue=1.06e-53; confidence=medium
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14291 (DUF4371)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024355

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057809844.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057809844.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809844.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809844.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057809844.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:38835974`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B66,C28,C68
`Chr5:38836003`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	B117,B56,B64,B82,C35,C40,C57,C60,C83
`Chr5:38836008`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B76,B77
`Chr5:38836021`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A23,B112,B15,B59,B89
`Chr5:38836034`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	9	A23,B112,B22,B38,B39,B65,B91,C44,C6
`Chr5:38836049`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B71
`Chr5:38836187`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,C60,C62,C82,D3
`Chr5:38836230`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B11,B136,C13,C45
`Chr5:38836230`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B11,B136,C13,C45
`Chr5:38836256`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B77
`Chr5:38836256`	`A`	`AC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B77
`Chr5:38836276`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B69,B9,C5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809844.1

330 aa

165

330

DUF4371

PF14291 DUF4371 185-285 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809844.1`	Pfam	`PF14291`	DUF4371	Domain	185	285	3.7e-09	37.2	ZMYM1/FAM200, RNase-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953861.1
TCCTCCCTTTCCTCTTTTTTTATTTTTTGACTTTGCCTCCCTTTCCTCTTAATCATACTTTCTTTCCTTCTTCCTGCAACTCCCAACGTCTCTTTTGCAATCCCAAAGGAAAAGGAATTAAGGAAAAGCCAATCCACCGACCAGAAAATTGCTTTGCTTGTAATCTAATTTGCTTCTCACTTTCTTGCACCGTGCCACCGTCGGCGACCACCGAAAAAAGGCTGCCCTCCGGTCACCACTGTCCACTGCTCTGGCAGTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024355
ATGTTGCCGAGAAAACATTTATCAGGAAGTGAAAAAAGAAAAAAAAGTGATGATATAAGGAAATCACAACAACGAGCTCTTGATAAATTTGTTTTGAAAAAGGATGGTTCTTCTTCTCATGACAATTTGAATCGATCAAATGAAAATTTAGACAATGAGAAAAATAAAATTGATGATTCTATTGACCATAATTTTGTGCCAAATGTGTCTAATATTGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAATTGTTACTCTTACTAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809844.1
MLPRKHLSGSEKRKKRXDDIRKSQQRALDKFVLKKDGSSSHDNLNRSNENLDNEKNKIDDSIDHNFVPNVSNIEEEEEEEEEIVTLTKENETIPHIDIYDPRNCNNLDTKAIDILVEKGPIREMNCEFPVDKNSRHFSYAYYSRKLSNGETSDRKWLVYCKYVDKVYCFCCKLFKSISNVSLLANEGLNDWKHKLQQHELSVEHMSNMKTWNELRMRLNTNETIDKYVQDEIMKEKERWRQVLHRIFSVVKCLAKHNLAF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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