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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003082`

染色体: Chr05 坐标: 38957005-38979398 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003082`
名称	SmilChr05G003082
描述	uncharacterized SmilChr05G003082
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	38957005 - 38979398 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024359`
GeneID	`131024359`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024359`
原始查询	`SmilChr05G003082`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841495]; symbol=AT1G50730; hit=AT1G50730; species=arabidopsis; confidence=high
产物	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841495]; symbol=AT1G50730; hit=AT1G50730; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G50730` (AT1G50730) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841495] identity=45.5; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`-` -
GO	GO:0005768 (endosome); GO:0032456 (endocytic recycling)
KEGG	-
Pfam	PF27614 (VPS35L_N); PF30377 (VPS35L_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024359

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057809847.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057809847.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809847.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809847.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057809847.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:38960793`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr5:38962118`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,B13,C60
`Chr5:38962151`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B125,B43,B80,C72
`Chr5:38965915`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B39
`Chr5:38978124`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C36
`Chr5:38978143`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809847.1

909 aa

454

909

VPS35L_N

VPS35L_C

PF27614 VPS35L_N 86-350 aa PF30377 VPS35L_C 390-903 aa

XP_057809848.1

906 aa

453

906

VPS35L_N

VPS35L_C

PF27614 VPS35L_N 86-347 aa PF30377 VPS35L_C 387-900 aa

XP_057809849.1

903 aa

452

903

VPS35L_N

VPS35L_C

PF27614 VPS35L_N 86-350 aa PF30377 VPS35L_C 390-897 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809847.1`	Pfam	`PF27614`	VPS35L_N	Repeat	86	350	4e-90	302.4	VPS35L
`XP_057809847.1`	Pfam	`PF30377`	VPS35L_C	Repeat	390	903	3.1e-52	178.4	VPS35L C-terminal domain
`XP_057809848.1`	Pfam	`PF27614`	VPS35L_N	Repeat	86	347	7.1e-89	298.3	VPS35L
`XP_057809848.1`	Pfam	`PF30377`	VPS35L_C	Repeat	387	900	3e-52	178.4	VPS35L C-terminal domain
`XP_057809849.1`	Pfam	`PF27614`	VPS35L_N	Repeat	86	350	4e-90	302.4	VPS35L
`XP_057809849.1`	Pfam	`PF30377`	VPS35L_C	Repeat	390	897	4e-55	187.9	VPS35L C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

10 records

下载 cDNA FASTA

XR_009101778.1
GACCTAAATGATAACTGGACGGGGTTGCACTCTATTTGACAAATAACAGAATGTATCGTGAGTTCAACCAGAAAGCCATAAGGTGAAGTCCATCGCGATTCTTCGGAATGGTTCGCGAGGTGCTGACAGCAGACGACGAGCTGGTGATGGCCGAAAGCCACGACAGTTGATCAAAACGGAGCGCCTCAAGTTGTAGTCACTTCTATTGTTCTTGTGTTGAACACAGTCGATGGGGCTTGAATTCAGGCGCCGAGACTACA...

XR_009101781.1
ACCTAAATGATAACTGGACGGGGTTGCACTCTATTTGACAAATAACAGAATGTATCGTGAGTTCAACCAGAAAGCCATAAGGTGAAGTCCATCGCGATTCTTCGGAATGGTTCGCGAGGTGCTGACAGCAGACGACGAGCTGGTGATGGCCGAAAGCCACGACAGTTGATCAAAACGGAGCGCCTCAAGTTGTAGTCACTTCTATTGTTCTTGTGTTGAACACAGTCGATGGGGCTTGAATTCAGGCGCCGAGACTACAG...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131024359
ATGGGGCTTGAATTCAGGCGCCGAGACTACAGAGCCGAGGAGCAGGCCCGCCCTCTCCAGAGAACGCGTGCTGATACTCACCCTCTCTCCGCTTCTTCTTCACCTCTCCAGGTGGAAGAATCTAGAAGTGGAAAAGATGATTTCTGCGATCCGCTTAGAGCAAGTGATTGGTCGATGGCAATGTCTTCCAGTGATGTACACCGTGAAGATGTTAGTACTGAGGCAACAGCGCCCTCTCAACTGAGAACGAGGAAGGAATG...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057809847.1
MGLEFRRRDYRAEEQARPLQRTRADTHPLSASSSPLQVEESRSGKDDFCDPLRASDWSMAMSSSDVHREDVSTEATAPSQLRTRKEWISFKKMLMQRFPVSKTSPISVASGVLVKGNKAIEKSSKDLHSGELDDDKNFDDEDVKVIGQQECLSKLQGLKDEINQSWCADDRVTSLRLSIKAVRFLMDSSAVQIYPTLFVLATDIMDMLGDLVWNRIKQKAGITEENFKTGEICFDAKGTCNNWFCKVGSVRELLPRIYLE...

XP_057809848.1
MGLEFRRRDYRAEEQARPLQRTRADTHPLSASSSPLQVEESRSGKDDFCDPLRASDWSMAMSSSDVHREDVSTEATAPSQLRTRKEWISFKKMLMQRFPVSKTSPISVASGVLVKAIEKSSKDLHSGELDDDKNFDDEDVKVIGQQECLSKLQGLKDEINQSWCADDRVTSLRLSIKAVRFLMDSSAVQIYPTLFVLATDIMDMLGDLVWNRIKQKAGITEENFKTGEICFDAKGTCNNWFCKVGSVRELLPRIYLELAI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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