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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003098`

染色体: Chr05 坐标: 39390307-39394146 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003098`
名称	SmilChr05G003098
描述	ribosome biogenesis protein BRX1 homolog 2-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	39390307 - 39394146 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024370`
GeneID	`131024370`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024370`
原始查询	`SmilChr05G003098`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ribosome biogenesis protein BRX1 homolog 2-like
产物	ribosome biogenesis protein BRX1 homolog 2-like
Arabidopsis	`AT3G15460` (AT3G15460) Ribosomal RNA processing Brix domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820785] identity=72.8; qcov=1; evalue=5.01e-170; confidence=high
Rice	`Os02g0591800` - identity=72; qcov=1.04; evalue=8.99e-160; confidence=high
GO	GO:0000027 (ribosomal large subunit assembly); GO:0005730 (nucleolus); GO:0006364 (rRNA processing); GO:0019843 (rRNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF04427 (Brix)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024370

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057809861.1`
2	Nucleolus	核仁	1.00000	`XP_057809861.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809861.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809861.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057809861.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:39391176`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B37
`Chr5:39391176`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B37
`Chr5:39391209`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88
`Chr5:39391237`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,B79
`Chr5:39391319`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,B103,B59
`Chr5:39391320`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	A20,B103,B59
`Chr5:39391320`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	3	A20,B103,B59
`Chr5:39391333`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A15,B65
`Chr5:39391574`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B103,B59,C78
`Chr5:39391625`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B59,C57,C80
`Chr5:39391632`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B33,B52,B59,C29,C7
`Chr5:39391668`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,B14

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809861.1

315 aa

158

315

Brix

PF04427 Brix 60-250 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809861.1`	Pfam	`PF04427`	Brix	Domain	60	250	3.3e-46	158.4	Brix domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953878.1
TTGTTTTTCGTTCAATTTTCTATGTTGATTGTAGTGATGGCTTCAAATTTTACTGTTGTTGGAGTTTAATTAAATCGGAATGGGGAAGAAGAGAAAGCACAGCGAAACCAATGCGGCGGAGAATGAGAAGAAGGAAGAAATCGCGCCGGAACGGCTGAAAAGAACGCTTTTCGGATTTAAAACCAGTCCTCAAGATATAAAGGAGAATGATACTACCCCTTTCTTCCGGAATAAAGTGAAAGTTTTGGTTACTTGTTCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024370
ATGGGGAAGAAGAGAAAGCACAGCGAAACCAATGCGGCGGAGAATGAGAAGAAGGAAGAAATCGCGCCGGAACGGCTGAAAAGAACGCTTTTCGGATTTAAAACCAGTCCTCAAGATATAAAGGAGAATGATACTACCCCTTTCTTCCGGAATAAAGTGAAAGTTTTGGTTACTTGTTCTCGCCGCATTAGTTACAGGTATCGGCATTTGATGTTGAACTTAATTGATTTATTGCCTCATTGTAAGAAAGATAACAAGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809861.1
MGKKRKHSETNAAENEKKEEIAPERLKRTLFGFKTSPQDIKENDTTPFFRNKVKVLVTCSRRISYRYRHLMLNLIDLLPHCKKDNKVESKGSKGTDLNELVELRSCSSCLFFECRKGKDLYLWMSKCPNGPSVKFLVNAVHTMEELKLTGNHLKGSRPILTFSSNFDKKPHFQLLKEMITQIFATPKDHRKSKPYHDHVFVFSIADDHIWFRNYQISSGHTGTAQKLDRGDLEKMTLVEVGPRFCLNPIKIFSGSFGGPT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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