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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003113`

染色体: Chr05 坐标: 39658496-39659656 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003113`
名称	SmilChr05G003113
描述	salviol synthase-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	39658496 - 39659656 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024381`
GeneID	`131024381`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024381`
原始查询	`SmilChr05G003113`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	salviol synthase-like
产物	salviol synthase-like
Arabidopsis	`AT3G26210` (CYP71B23) cytochrome P450, family 71, subfamily B, polypeptide 23 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822222] identity=34.9; qcov=1.04; evalue=8.02e-45; confidence=low
Rice	`Os09g0275400` - identity=36.4; qcov=1.04; evalue=9.66e-60; confidence=medium
GO	GO:0004497 (monooxygenase activity); GO:0005506 (iron ion binding); GO:0016705 (oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen); GO:0020037 (heme binding)
KEGG	-
Pfam	PF00067 (p450)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024381

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057809866.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057809866.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057809866.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809866.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809866.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:39658585`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B21,B42,B76,C39,C50
`Chr5:39658593`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr5:39658608`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B2,B82,C87,D4,D5
`Chr5:39658608`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B2,B82,C87,D4,D5
`Chr5:39658670`	`CTG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	7	B124,B135,B93,C48,C57,C60,C71
`Chr5:39658726`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B118,B73
`Chr5:39658736`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B22,C48,D4
`Chr5:39658773`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B19,C31,C35
`Chr5:39658777`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B137,B19,C31,C35
`Chr5:39658881`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:39658921`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B115,C33,C39,C61,C83
`Chr5:39658931`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B4,C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809866.1

262 aa

131

262

p450

PF00067 p450 1-261 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809866.1`	Pfam	`PF00067`	p450	Domain	1	261	1.8e-33	116.8	Cytochrome P450

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953883.1
TCGGTCCCATGATGGGCCTTCAGCTTGGTGAACTATCTGTTGTCGTCATTTCCTCAGCTGATGCTGCTAAGCAGATAATGAAAACTCACGACATCAACTTCGCGTCGCGGCCTCCCATCATAGCAGCGGAGATAATCAGTTATGGGTGCACCAGCATCACCTTCAGCCCTCACTCTGATTACTGGAGGCAGCTCCGCAAACTCTGCACCTTGGATTTTCTCAGCAACAAACGTGTTCAGTCGTTCCGATTGCTGCAAGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024381
ATGATGGGCCTTCAGCTTGGTGAACTATCTGTTGTCGTCATTTCCTCAGCTGATGCTGCTAAGCAGATAATGAAAACTCACGACATCAACTTCGCGTCGCGGCCTCCCATCATAGCAGCGGAGATAATCAGTTATGGGTGCACCAGCATCACCTTCAGCCCTCACTCTGATTACTGGAGGCAGCTCCGCAAACTCTGCACCTTGGATTTTCTCAGCAACAAACGTGTTCAGTCGTTCCGATTGCTGCAAGAGAAAGTGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809866.1
MMGLQLGELSVVVISSADAAKQIMKTHDINFASRPPIIAAEIISYGCTSITFSPHSDYWRQLRKLCTLDFLSNKRVQSFRLLQEKVFADLNRWIASMVGSSINLTAELYNSTYALISRATLGDHTTEHEVLLPILKEVIEISAGFDIAELFPSVKVLQGVSGLRRRIMVLHKEADKILEDVVRQHRGVKVEEHEDLLDVLLRVEEEGLELPLTTDNIKSVLVDMLGAGSETSATTMDWVMAEMLKNPRVLEKAQHEVRKV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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