当前解析结果
SmilChr05G003126| 统一新 Gene ID | SmilChr05G003126 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G003126 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G003126 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 39897749 - 39898556 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131024390 |
|---|---|
| GeneID | 131024390 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131024390 |
| 原始查询 | SmilChr05G003126 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131024390 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057809874.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057809874.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.20000 | XP_057809874.1 |
| 4 | Nucleoplasm | 核质 | 0.20000 | XP_057809874.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057809874.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:39897871 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B127,D2 |
Chr5:39897882 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B135,B97 |
Chr5:39898026 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B104,B30,B40,B47,D9 |
Chr5:39898036 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B10,B37,C26,C35,C87 |
Chr5:39898062 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B107,C37,C64,C9 |
Chr5:39898077 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 12 | A25,B104,B26,B30,B40,B47,B52,B61,B77,B79,C40,D9 |
Chr5:39898083 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A3,B101,B117,B12 |
Chr5:39898092 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B71 |
Chr5:39898099 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B48,C37 |
Chr5:39898110 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B107,C37,C64,C9 |
Chr5:39898138 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B135,C27 |
Chr5:39898157 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B132 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。