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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003127`

染色体: Chr05 坐标: 39904125-39905306 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003127`
名称	SmilChr05G003127
描述	uncharacterized SmilChr05G003127
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	39904125 - 39905306 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025917`
GeneID	`131025917`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025917`
原始查询	`SmilChr05G003127`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Gag-Pol polyprotein/retrotransposon [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28721235]; symbol=AT5G39775; hit=AT5G39775; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	Gag-Pol polyprotein/retrotransposon [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28721235]; symbol=AT5G39775; hit=AT5G39775; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT5G39775` (AT5G39775) Gag-Pol polyprotein/retrotransposon [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28721235] identity=33.7; qcov=0.234; evalue=9.81e-06; confidence=weak
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03732 (PEG10_N-capsid)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025917

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057811678.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057811678.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057811678.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811678.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811678.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:39904147`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B83,C52,C84
`Chr5:39904147`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B83,C52,C84
`Chr5:39904178`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27
`Chr5:39904198`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr5:39904207`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B27,B55
`Chr5:39904242`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B27,C42
`Chr5:39904248`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr5:39904279`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C33
`Chr5:39904296`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C33
`Chr5:39904305`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A9,B103,B8,C12,C57
`Chr5:39904307`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27
`Chr5:39904329`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B122,B21,B58,C2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811678.1

393 aa

196

393

PEG10_N-capsid

PF03732 PEG10_N-capsid 43-118 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811678.1`	Pfam	`PF03732`	PEG10_N-capsid	Domain	43	118	1.7e-10	41.8	Retrotransposon-derived protein PEG10, N-terminal capsid-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955695.1
ATGGAGGCATTGATCCAGCGAATTCCTGGTGTCCCGGCACCCATCTACAAAAGCTCAGAGAATTGCTACGCCGACTCGCCATTCGTGGATGAGATTGCCTTAGTTGAAATGCCGGTCAAGTTCAACTTTCCGAGCATGCAAATGTTTGATGGAACAACGGATCCGACCGACCACATAGCTCAATATAAGCAAAGGATGTTCATTGCCGCAATTCCTCGTGAATTGAGGCAAGCCTACATATGTAAGGGGTTCGGTTCTAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025917
ATGGAGGCATTGATCCAGCGAATTCCTGGTGTCCCGGCACCCATCTACAAAAGCTCAGAGAATTGCTACGCCGACTCGCCATTCGTGGATGAGATTGCCTTAGTTGAAATGCCGGTCAAGTTCAACTTTCCGAGCATGCAAATGTTTGATGGAACAACGGATCCGACCGACCACATAGCTCAATATAAGCAAAGGATGTTCATTGCCGCAATTCCTCGTGAATTGAGGCAAGCCTACATATGTAAGGGGTTCGGTTCTAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811678.1
MEALIQRIPGVPAPIYKSSENCYADSPFVDEIALVEMPVKFNFPSMQMFDGTTDPTDHIAQYKQRMFIAAIPRELRQAYICKGFGSSLIGPALQWYTNLPNYSISSFAQLTDIFVQQYASSKKLEKISEDLYAMIQRRDESLRDYIGRFNKEKVSITNCSTQTAITTFRKSLLPDSDLYKDLTKYPCKTMEDVLAKAWAQIKWEEDQYNHHRSSSSRHTRRDSRVERRTSDRRSEPYPPPRQDYRRRQFDHPYESRPHER...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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