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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003129`

染色体: Chr05 坐标: 39917177-39925436 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003129`
名称	SmilChr05G003129
描述	uncharacterized SmilChr05G003129
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	39917177 - 39925436 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025918`
GeneID	`131025918`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025918`
原始查询	`SmilChr05G003129`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629]; symbol=AT2G01050; hit=AT2G01050; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629]; symbol=AT2G01050; hit=AT2G01050; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT2G01050` (AT2G01050) zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629] identity=31.4; qcov=0.151; evalue=3.17e-19; confidence=weak
Rice	`Os06g0484800` - identity=36; qcov=0.134; evalue=1.34e-15; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1); PF14392 (zf-CCHC_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025918

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057811679.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057811679.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057811679.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811679.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811679.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:39917196`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr5:39917219`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88
`Chr5:39917232`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr5:39917265`	`G`	`GAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	55	A14,A20,A24,A6,B100,B106,B114,B117,B119,B121,B122,B127,B129,B131,B134,B136,B14,B18,B34,B35,B40,B42,B45,B46,B55,B66,B67,B69,B70,B73,B88,B97,C13,C17,C24,C29,C3,C35,C37,C39,C5,C56,C61,C62,C66,C68,C74,C79,C81,C87,D1,D3,D4,D5,D6
`Chr5:39917289`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	B100,B14,B73,B94,C13
`Chr5:39917289`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	CDS_variant	5	B100,B14,B73,B94,C13
`Chr5:39917293`	`TTA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	B100,B14,B73,B94,C13
`Chr5:39917293`	`TTA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	5	B100,B14,B73,B94,C13
`Chr5:39917304`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C68
`Chr5:39917304`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C68
`Chr5:39917322`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr5:39917330`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	23	A5,B100,B12,B125,B130,B64,B69,B89,B90,B99,C10,C21,C29,C33,C36,C64,C7,C78,C80,C84,C9,D4,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811679.1

1014 aa

507

1014

zf-CCHC_4

RVT_1

PF14392 zf-CCHC_4 102-149 aa PF00078 RVT_1 672-784 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811679.1`	Pfam	`PF14392`	zf-CCHC_4	Domain	102	149	4.6e-08	33.3	Zinc knuckle
`XP_057811679.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	672	784	5.6e-09	36.9	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955696.1
ATGGGTAAAGGATATTACACGTTAAAATTCCATAATAAGGAGGATAAAGCGAAGGCAAAATCGCATCTTATTTGGGATCTTCCCGCAGGCTCTTTAAGATTGCGTGATTGGGTTCGTTACTTTAATCCTTACAAAGAATCTTCTTCGTTAGCACAAGTGTGGGTTAGAATTTATTATTTGCCTGTCGGTTTTTGGCACCCTGAAGTTTTAGCAGGCATCGGACGTTGGCTTGGGCAGCCTCTGAAAATTGATGGTAATTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025918
ATGGGTAAAGGATATTACACGTTAAAATTCCATAATAAGGAGGATAAAGCGAAGGCAAAATCGCATCTTATTTGGGATCTTCCCGCAGGCTCTTTAAGATTGCGTGATTGGGTTCGTTACTTTAATCCTTACAAAGAATCTTCTTCGTTAGCACAAGTGTGGGTTAGAATTTATTATTTGCCTGTCGGTTTTTGGCACCCTGAAGTTTTAGCAGGCATCGGACGTTGGCTTGGGCAGCCTCTGAAAATTGATGGTAATTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811679.1
MGKGYYTLKFHNKEDKAKAKSHLIWDLPAGSLRLRDWVRYFNPYKESSSLAQVWVRIYYLPVGFWHPEVLAGIGRWLGQPLKIDGNSMDDEVAHFARILVEIDLAQPLPETMAIDDGEYSFNIEFNYEYLPLFCTRCRITGHSVDKCRKGKRVTKAAEELVKPKEPEWHAVGKDVNKPSSSGKDVSKELENILAAEPEEQQKGARDRISLKRCVLNDLGFHDTEVGAASQQGFQQDQNVGGHQDLEVTIVQENELHSPRR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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