当前解析结果
SmilChr05G003134| 统一新 Gene ID | SmilChr05G003134 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr05G003134 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr05G003134 |
| 染色体 / SeqID | Chr05 / NC_080391.1 |
| 坐标与链方向 | 39955197 - 39959659 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131024396 |
|---|---|
| GeneID | 131024396 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131024396 |
| 原始查询 | SmilChr05G003134 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | inositol-1,4,5-trisphosphate 5-phosphatase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828810]; symbol=AT4G27020; hit=AT4G27020; species=arabidopsis; confidence=high |
| 产物 | inositol-1,4,5-trisphosphate 5-phosphatase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828810]; symbol=AT4G27020; hit=AT4G27020; species=arabidopsis; confidence=high |
| Arabidopsis | AT4G27020 (AT4G27020)inositol-1,4,5-trisphosphate 5-phosphatase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828810] identity=75.2; qcov=0.949; evalue=0; confidence=high |
| Rice | Os01g0793500 (P0684C02.6-2)- identity=71.7; qcov=0.928; evalue=0; confidence=high |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131024396 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Golgi apparatus | 高尔基体 | 0.60000 | XP_057809877.1 |
| 2 | Vacuole | 液泡 | 0.40000 | XP_057809877.1 |
| 3 | Lysosome | 溶酶体 | 0.20000 | XP_057809877.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057809877.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057809877.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr5:39957332 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B82 |
Chr5:39957435 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A9,B104,B65,C36 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。