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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003137`

染色体: Chr05 坐标: 39988152-39992600 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003137`
名称	SmilChr05G003137
描述	uncharacterized SmilChr05G003137
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	39988152 - 39992600 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024399`
GeneID	`131024399`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024399`
原始查询	`SmilChr05G003137`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DTW domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835579]; symbol=AT5G54880; hit=AT5G54880; species=arabidopsis; confidence=high
产物	DTW domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835579]; symbol=AT5G54880; hit=AT5G54880; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G54880` (AT5G54880) DTW domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835579] identity=46.6; qcov=0.956; evalue=4.91e-96; confidence=high
Rice	`Os03g0568600` - identity=57.2; qcov=0.396; evalue=4.88e-51; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03942 (DTW)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024399

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057809879.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057809879.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809879.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809879.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057809879.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:39988795`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B71
`Chr5:39988795`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B71
`Chr5:39989029`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B94,C9
`Chr5:39989188`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B38

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809879.1

384 aa

192

384

DTW

PF03942 DTW 52-116 aa PF03942 DTW 244-370 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809879.1`	Pfam	`PF03942`	DTW	Domain	52	116	1.5e-37	130.0	DTW domain
`XP_057809879.1`	Pfam	`PF03942`	DTW	Domain	244	370	1.5e-37	130.0	DTW domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

5 records

下载 cDNA FASTA

XR_009101809.1
CGCCCACTGCAGATGTTCTAAACGCAATGCCCGCCTTCTCCAAATTGCAACAGGGTATCTCGCAATTCTACTCTCCCTTTCTCAACCATATATCTTTAACCAACAAAATCGCCAAATCCCTTCAGTTTCACCCCCTAACCCTAATTTCGCTAATGGTGACTGCATCCGCTTCTACAAAGAGACCCACTTGTCCATCATGCTCTAAACCGGCCAGCATTTGCCTTTGCAGCCGCCTCCGAACTCCGCTTCTCCATAATTCT...

XR_009101807.1
CGCCCACTGCAGATGTTCTAAACGCAATGCCCGCCTTCTCCAAATTGCAACAGGGTATCTCGCAATTCTACTCTCCCTTTCTCAACCATATATCTTTAACCAACAAAATCGCCAAATCCCTTCAGTTTCACCCCCTAACCCTAATTTCGCTAATGGTGACTGCATCCGCTTCTACAAAGAGACCCACTTGTCCATCATGCTCTAAACCGGCCAGCATTTGCCTTTGCAGCCGCCTCCGAACTCCGCTTCTCCATAATTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024399
ATGCCCGCCTTCTCCAAATTGCAACAGGGTATCTCGCAATTCTACTCTCCCTTTCTCAACCATATATCTTTAACCAACAAAATCGCCAAATCCCTTCAGTTTCACCCCCTAACCCTAATTTCGCTAATGGTGACTGCATCCGCTTCTACAAAGAGACCCACTTGTCCATCATGCTCTAAACCGGCCAGCATTTGCCTTTGCAGCCGCCTCCGAACTCCGCTTCTCCATAATTCTGTCTCCGTCACCATTTTCCAACATAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809879.1
MPAFSKLQQGISQFYSPFLNHISLTNKIAKSLQFHPLTLISLMVTASASTKRPTCPSCSKPASICLCSRLRTPLLHNSVSVTIFQHSLEKNHPLNSARIAKIGLKNVNVVTVSDVNFEAQFFIRPLKVDESCHLFDEMPSKGRNDEFLETANLGADYADLEGRIMGRNEFNVAETSQLCQHVMNLKGSELSAFDFTIAKSGTISSMTCKMGPAKIQEMSFDQLLASDAAVDEIRKGFVVKKVQVSEAFGECEEVEEFEIA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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