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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003149`

染色体: Chr05 坐标: 40227810-40229807 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003149`
名称	SmilChr05G003149
描述	uncharacterized SmilChr05G003149
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	40227810 - 40229807 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025922`
GeneID	`131025922`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025922`
原始查询	`SmilChr05G003149`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0003723 (RNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025922

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057811685.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057811685.1`
3	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057811685.1`
4	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.20000	`XP_057811685.1`
5	P-body	P-body	0.20000	`XP_057811685.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:40227866`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,B6,C34
`Chr5:40227874`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A7
`Chr5:40227935`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B112,B26,C72
`Chr5:40227942`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	B108,B117,B72,C23,C68,C8,C82,D4
`Chr5:40227956`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B72,C68,D4
`Chr5:40227983`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B102,B112,B26,C72
`Chr5:40228232`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,B76
`Chr5:40228272`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C25
`Chr5:40228274`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	13	B101,B108,B114,B135,B28,B5,B50,B66,B85,C25,C44,C67,C83
`Chr5:40228300`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B135
`Chr5:40228393`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D5
`Chr5:40228397`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B71,B91,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811685.1

528 aa

264

528

RRM_1

PF00076 RRM_1 47-112 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811685.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	47	112	1.9e-09	38.0	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955702.1
ATGGGCAAGGGAGAAGGAAGCTGGATGGAGGTGAGGCGAAGAGGAGAGAACTCCAAAGCAAAGTTCAAGATTGCTTCAGGGAATCATGGAGAGAACCAGGAGAAACGGGCTTGGGGAAACACGGTCACTTTTCTCTTCAACAACTTCCCGGAAGGAACTTGGTTGGAGACTCTGGAGAAAAGCTTCAAAAGAATTGGCAAAGTCATGGATATTTTCTGCCCTAGGAAGAGAGATATCAAGGGCAAACCTTTCGGTTTTGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025922
ATGGGCAAGGGAGAAGGAAGCTGGATGGAGGTGAGGCGAAGAGGAGAGAACTCCAAAGCAAAGTTCAAGATTGCTTCAGGGAATCATGGAGAGAACCAGGAGAAACGGGCTTGGGGAAACACGGTCACTTTTCTCTTCAACAACTTCCCGGAAGGAACTTGGTTGGAGACTCTGGAGAAAAGCTTCAAAAGAATTGGCAAAGTCATGGATATTTTCTGCCCTAGGAAGAGAGATATCAAGGGCAAACCTTTCGGTTTTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811685.1
MGKGEGSWMEVRRRGENSKAKFKIASGNHGENQEKRAWGNTVTFLFNNFPEGTWLETLEKSFKRIGKVMDIFCPRKRDIKGKPFGFVRFEKGIDSKRTLEELNNIWIGSFKLRAYLPRFERGMEGEAKPNSFEGSAQQAMGMMSQFTNGLPVIADSHKPAGSSRGNPERKTFAEAVVRSNHVSKHPPEAFFDFVASEEETNWLKKAFTGYVKSDFPWEEFGEEIKSECAGHFKITPMGGNLVLIQSDNMKSVDESLKGLD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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