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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003153`

染色体: Chr05 坐标: 40272717-40275342 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003153`
名称	SmilChr05G003153
描述	uncharacterized SmilChr05G003153
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	40272717 - 40275342 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025924`
GeneID	`131025924`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025924`
原始查询	`SmilChr05G003153`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os11g0672600; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os11g0672600; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`ATMG01250` - identity=38.9; qcov=0.121; evalue=3.92e-07; confidence=weak
Rice	`Os11g0672600` - identity=31.2; qcov=0.492; evalue=3.05e-30; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025924

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057811687.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057811687.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057811687.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811687.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057811687.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:40272737`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B90,B92,C55,D11
`Chr5:40272749`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B68
`Chr5:40272749`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B68
`Chr5:40272753`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B68
`Chr5:40272753`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B68
`Chr5:40272757`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B129,B65,C17,C36
`Chr5:40272795`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	154	A10,A14,A15,A16,A18,A19,A2,A21,A22,A24,A25,A5,A6,A7,A8,A9,B102,B104,B106,B107,B109,B111,B112,B113,B115,B119,B12,B121,B122,B123,B126,B128,B129,B130,B133,B134,B135,B137,B138,B139,B140,B15,B18,B2,B20,B21,B23,B24,B27,B29,B31,B35,B36,B37,B38,B39,B4,B40,B42,B43,B44,B47,B48,B49,B5,B51,B52,B53,B56,B57,B59,B60,B61,B62,B64,B66,B67,B7,B71,B74,B75,B76,B78,B81,B83,B84,B86,B87,B88,B89,B90,B91,B92,B96,B98,B99,C1,C11,C12,C16,C19,C20,C22,C23,C24,C25,C27,C3,C30,C32,C33,C34,C35,C38,C4,C41,C42,C43,C44,C46,C47,C49,C5,C51,C52,C53,C55,C56,C59,C6,C60,C61,C62,C64,C65,C66,C67,C68,C69,C7,C71,C76,C77,C78,C79,C8,C80,C82,C86,C87,C9,D1,D3,D5
`Chr5:40272806`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B122,B135,B99,C3
`Chr5:40272809`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C27,D4
`Chr5:40272819`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr5:40272831`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B133,B134,B97,C39
`Chr5:40272848`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	61	A1,A11,A13,A18,A19,A20,A21,A6,A7,B10,B101,B104,B105,B108,B11,B110,B114,B120,B121,B125,B126,B133,B134,B135,B138,B15,B16,B27,B33,B38,B40,B41,B43,B45,B58,B62,B72,B73,B79,B82,B83,B89,B91,B96,C11,C14,C16,C22,C32,C34,C35,C39,C48,C52,C59,C64,C66,C87,D11,D4,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811687.1

594 aa

297

594

RVT_1

PF00078 RVT_1 113-311 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811687.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	113	311	1.2e-19	71.7	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955704.1
ATGGTTAAATGGCATCGTTCCAATCAAATCATCAAGAAGCTTAGTATTGATGGTGTTATCTCGGAGGACCAGGCTACCATGGCGGCTCATGTGATTCAGTTCCATGAGGATCTCTTTTCTGAGCCGATTTCTGGCGTGGTGGACAGGTCCTGGATTTCTGGTTACATTCCTTCCTCTGTCACCTCGCCGCAGGCTGACTTACTTACTGCTCTCCCTTCAGCAGATGATATTCGTTCGGTGGTCTTCTCCATGGATAGAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025924
ATGGTTAAATGGCATCGTTCCAATCAAATCATCAAGAAGCTTAGTATTGATGGTGTTATCTCGGAGGACCAGGCTACCATGGCGGCTCATGTGATTCAGTTCCATGAGGATCTCTTTTCTGAGCCGATTTCTGGCGTGGTGGACAGGTCCTGGATTTCTGGTTACATTCCTTCCTCTGTCACCTCGCCGCAGGCTGACTTACTTACTGCTCTCCCTTCAGCAGATGATATTCGTTCGGTGGTCTTCTCCATGGATAGAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811687.1
MVKWHRSNQIIKKLSIDGVISEDQATMAAHVIQFHEDLFSEPISGVVDRSWISGYIPSSVTSPQADLLTALPSADDIRSVVFSMDRNSALGPDDFNGAFFQHSWEVADAILVSNYRPIVLGNFFFKVITKILASRLNAVAAEIVSANQFDFISGRSIQECILLASEGVNCMERSIQRRNMVLKVDIRKAFDTLSWEFVDVVLDSFGFPPLFRQWIRVIFQSAWISVLFNGEQHGFFSCSRGVRHVDPLSSILFSLAEEVL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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