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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003155`

染色体: Chr05 坐标: 40302478-40305271 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003155`
名称	SmilChr05G003155
描述	uncharacterized SmilChr05G003155
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	40302478 - 40305271 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024411`
GeneID	`131024411`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024411`
原始查询	`SmilChr05G003155`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	TTF-type zinc finger protein with HAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838509]; symbol=AT1G19260; hit=AT1G19260; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	TTF-type zinc finger protein with HAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838509]; symbol=AT1G19260; hit=AT1G19260; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G19260` (AT1G19260) TTF-type zinc finger protein with HAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838509] identity=46.3; qcov=0.876; evalue=1.43e-47; confidence=medium
Rice	`-` -
GO	GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF05699 (Dimer_Tnp_hAT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024411

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057809906.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057809906.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809906.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057809906.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057809906.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:40304605`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr5:40304644`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B34
`Chr5:40304648`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B37,C11,C42,C69
`Chr5:40304682`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,B66
`Chr5:40304708`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B45
`Chr5:40304712`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	A8,B139,B27,B30,B45,B82
`Chr5:40304716`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C71,D1
`Chr5:40304840`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C15,C55
`Chr5:40304862`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C15,C55,C8
`Chr5:40304871`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B105,B114,C21,C82
`Chr5:40304885`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B51
`Chr5:40304888`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	15	B102,B119,B124,B136,B3,B38,B39,B47,B53,B56,B61,B96,C14,C56,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809906.1

202 aa

101

202

Dimer_Tnp_hAT

PF05699 Dimer_Tnp_hAT 103-162 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809906.1`	Pfam	`PF05699`	Dimer_Tnp_hAT	Domain	103	162	8.2e-07	29.5	hAT family C-terminal dimerisation region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009101817.1
GAGAATTGTGATTATGATTGACATTCAATTAATTCCACTCTCTATTTCGTCTATTAATTTGTTAATTAATTTCGTTTATTAATAGGGTATTATTTATCTATTAATTTCAGCTTAGCAATCAATTTATTAATTTGAATTAATTTAATTTTATAGGAAATTGAACGTTTTTTTTCTAAAAAACGTAGAGGTGAATCTTCAAGTTGTTCAATTACACCTTTTATTGGAGCAAATGCTGAAGCAAATGTAGAAGTTGAAGAAAA...

XM_057953923.1
TTAGATCACAAGCTCGTGAGTTGGATGTTGCTTACCGCGCTCGTTTGACGGCTTCATTGGATGTGAGTCGTTTTCTATTGAAGCAAGGAATGCCTTTTCGTGGAAACGATGAGTCAACTAGTTCTTCAAATCGAGGTTGTTGATTTAATCATACAAGAGATGAATAATCGTTTTTCTGAAGCTAGCACCGATCTACTTAGATGCATGGCATGTCTTGATCCAACAGATTCTTTCTCCCAATTTGACATTAATCAACTCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024411
ATGAGTCAACTAGTTCTTCAAATCGAGGTTGTTGATTTAATCATACAAGAGATGAATAATCGTTTTTCTGAAGCTAGCACCGATCTACTTAGATGCATGGCATGTCTTGATCCAACAGATTCTTTCTCCCAATTTGACATTAATCAACTCATGCGTTTTACTACTTGGTATCCTGAAGACTTCTCCGCAGGTGATTGTTTATGTCTGCCACAACAACTCCGTAATTTCATAGTACTTGTGCGGCATCATCCTCGCTTTTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809906.1
MSQLVLQIEVVDLIIQEMNNRFSEASTDLLRCMACLDPTDSFSQFDINQLMRFTTWYPEDFSAGDCLCLPQQLRNFIVLVRHHPRFSTITDLGSFAQEMVKSGNHLIFQLVYRMIELTLVLPVATASVERAFSAMKLVKSDLRNRMQDEWMNDSLIVYIEKDIFSTIDNEKILQRFQSMSTRRNQLSSLSQTETTSSPSIYS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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